More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2889 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 342 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  65 
 
 		 334 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  65.33 
 
 		 334 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  60.18 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  60.18 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  60.18 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  59.28 
 
 		 334 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  59.58 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  60.94 
 
 		 334 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  59.88 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  60.18 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  59.28 
 
 		 334 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  60.18 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  60.18 
 
 		 334 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  58.98 
 
 		 334 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  58.68 
 
 		 334 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  59.28 
 
 		 334 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  58.68 
 
 		 334 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  60.33 
 
 		 335 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  59 
 
 		 338 aa  378  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  57 
 
 		 299 aa  362  7.0000000000000005e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  56.03 
 
 		 315 aa  360  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  56.76 
 
 		 314 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  56.76 
 
 		 314 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 323 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 323 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 322 aa  350  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 324 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 324 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 324 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 324 aa  345  8e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  55 
 
 		 415 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  55 
 
 		 435 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  55 
 
 		 428 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 324 aa  339  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 318 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  49.17 
 
 		 318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 313 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 		 300 aa  309  4e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3326  LysR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 319 aa  308  8e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.424785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  50.68 
 
 		 301 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0800  LysR family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 303 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.440519 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  48.17 
 
 		 304 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 303 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  46.76 
 
 		 298 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 303 aa  296  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 306 aa  296  4e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 304 aa  295  6e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0674  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 		 315 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6256  LysR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 304 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  50.66 
 
 		 304 aa  293  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5274  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 321 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 340 aa  293  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 303 aa  293  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  48.52 
 
 		 303 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  48.52 
 
 		 303 aa  292  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  46.6 
 
 		 295 aa  291  7e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  47.25 
 
 		 309 aa  290  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09910  putative transcriptional regulator  49.66 
 
 		 307 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5951  LysR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 305 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 303 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2017  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 308 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.304165  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  48.81 
 
 		 305 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 298 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1024  LysR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1356  transcriptional regulator, LysR family  45.64 
 
 		 314 aa  286  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 297 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0322  LysR family transcriptional regulator  49.34 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.844631 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 299 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4337  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 313 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  48.81 
 
 		 304 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1156  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 300 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234191  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 316 aa  283  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5596  transcriptional regulator, LysR family  45.61 
 
 		 308 aa  282  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0488  LysR family transcriptional regulator  47.49 
 
 		 309 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 303 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 299 aa  281  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1032  transcriptional regulator, LysR family  47.84 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 305 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 299 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 308 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1623  LysR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 303 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  46.76 
 
 		 297 aa  278  8e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 305 aa  278  9e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  47.8 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 305 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  46.33 
 
 		 303 aa  276  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2368  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 313 aa  276  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3447  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.800287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  47.46 
 
 		 314 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  46.33 
 
 		 303 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>