More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I2818 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  95.32 
 
 
299 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  95.32 
 
 
299 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  95.32 
 
 
299 aa  579  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  95.32 
 
 
327 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  94.65 
 
 
299 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  94.31 
 
 
299 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0488  LysR family transcriptional regulator  69.57 
 
 
309 aa  430  1e-119  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  71.43 
 
 
300 aa  422  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  64.09 
 
 
316 aa  398  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3338  transcriptional regulator, LysR family  61.07 
 
 
301 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  61.07 
 
 
297 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  60.87 
 
 
297 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  59.73 
 
 
314 aa  360  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1035  transcriptional regulator, LysR family  53.4 
 
 
303 aa  326  3e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693724  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2295  LysR family transcriptional regulator  53.25 
 
 
314 aa  317  1e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126851 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  52.2 
 
 
334 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  52.23 
 
 
334 aa  311  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  51.86 
 
 
334 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  51.86 
 
 
334 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  51.86 
 
 
334 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  51.86 
 
 
334 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  51.86 
 
 
334 aa  310  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  51.86 
 
 
334 aa  310  2e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  51.89 
 
 
334 aa  308  5e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  51.89 
 
 
334 aa  308  5e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  51.89 
 
 
334 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 
334 aa  308  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  51.53 
 
 
334 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  51.03 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  51.19 
 
 
334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  48.64 
 
 
315 aa  301  6.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1410  LysR family transcriptional regulator  51.35 
 
 
301 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  normal  0.531112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 
338 aa  301  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  48.3 
 
 
314 aa  298  5e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  48.3 
 
 
314 aa  298  5e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  50.69 
 
 
298 aa  298  9e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 
299 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4263  LysR family transcriptional regulator  48.32 
 
 
305 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  46.9 
 
 
299 aa  288  7e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  45.92 
 
 
295 aa  288  9e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  49.65 
 
 
306 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  47.97 
 
 
324 aa  287  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 
324 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 
324 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 
324 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 
323 aa  286  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1523  transcriptional regulator, LysR family  48.81 
 
 
308 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.072714  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 
342 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4320  LysR family transcriptional regulator  45.97 
 
 
298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3062  LysR family transcriptional regulator  47.97 
 
 
300 aa  281  1e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 
335 aa  281  1e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  48.97 
 
 
303 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0812  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 
309 aa  279  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108647  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1474  transcriptional regulator, LysR family  47.46 
 
 
308 aa  279  5e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0906205  hitchhiker  0.00000000107366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 
303 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  48.63 
 
 
303 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  47.32 
 
 
303 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 
303 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  49.31 
 
 
298 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 
303 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  48.46 
 
 
305 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 
303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 
324 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 
303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 
415 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 
428 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  46.6 
 
 
435 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  45.79 
 
 
322 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0176  transcriptional regulator, LysR family  48.8 
 
 
305 aa  272  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2751  transcriptional regulator, LysR family  46.76 
 
 
305 aa  271  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  46.46 
 
 
324 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5815  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 
311 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.163492 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0247  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
305 aa  270  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000112344 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3774  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
305 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0246  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 
307 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0246  LysR family transcriptional regulator  44.9 
 
 
307 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0249  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 
307 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3011  LysR family transcriptional regulator  48.8 
 
 
297 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0248  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
305 aa  268  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000146756 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  47.12 
 
 
304 aa  267  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  45.76 
 
 
304 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2403  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121442  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2483  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
309 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2532  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
309 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2508  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
309 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1872  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
349 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0158  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 
305 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0910  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
306 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1429  transcriptional regulator, LysR family  47.77 
 
 
303 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 
306 aa  260  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1623  LysR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
303 aa  259  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0343  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 
301 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119242  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0322  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 
305 aa  258  7e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.844631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  43.05 
 
 
301 aa  258  8e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2691  LysR family transcriptional regulator  48.66 
 
 
298 aa  257  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.993609  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  44.48 
 
 
300 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>