More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0793 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  93.49 
 
 		 428 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 415 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  95.06 
 
 		 324 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  94.02 
 
 		 435 aa  763    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  83.95 
 
 		 324 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  84.26 
 
 		 324 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  83.95 
 
 		 324 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  83.33 
 
 		 324 aa  570  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  84.26 
 
 		 323 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  84.26 
 
 		 323 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  81.79 
 
 		 322 aa  552  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  79.63 
 
 		 324 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  66.24 
 
 		 334 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  66.24 
 
 		 334 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  66.24 
 
 		 334 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  66.24 
 
 		 334 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  66.24 
 
 		 334 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  66.24 
 
 		 334 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  66.24 
 
 		 334 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  65.92 
 
 		 334 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  65.61 
 
 		 334 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  65.92 
 
 		 334 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  65.61 
 
 		 334 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  64.97 
 
 		 334 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  64.97 
 
 		 334 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  64.97 
 
 		 334 aa  434  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  64.33 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  64.01 
 
 		 334 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  63.06 
 
 		 334 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  56.07 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 335 aa  364  2e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 342 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  50.49 
 
 		 314 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  50.49 
 
 		 314 aa  338  9.999999999999999e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  49.33 
 
 		 315 aa  327  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 318 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  49.66 
 
 		 318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3326  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 319 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.424785 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 305 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 305 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 299 aa  305  7e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 305 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 305 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 305 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0800  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 303 aa  296  6e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.440519 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 304 aa  290  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 298 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1156  LysR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 300 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 298 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 340 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 308 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 313 aa  282  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  45.3 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2402  LysR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 372 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 301 aa  278  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4337  LysR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 313 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 303 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 		 300 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  45.45 
 
 		 305 aa  275  7e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  45.08 
 
 		 295 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3707  LysR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381625  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3814  LysR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 334 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.412952 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1032  transcriptional regulator, LysR family  43.67 
 
 		 305 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4656  LysR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 297 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  45.7 
 
 		 304 aa  273  5.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3447  LysR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 305 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.800287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 300 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 299 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 300 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 327 aa  271  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2751  transcriptional regulator, LysR family  44.75 
 
 		 305 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 299 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 299 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3728  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 297 aa  269  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 304 aa  269  7e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 299 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0255  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1685  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256836  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1773  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.790633  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1270  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.436877  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1103  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130627  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0101  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 309 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 300 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0323  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 316 aa  268  2e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 300 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  42.71 
 
 		 302 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  42.71 
 
 		 302 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  43.77 
 
 		 314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  44.56 
 
 		 297 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1664  LysR substrate binding domain protein  42.71 
 
 		 302 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5481  transcriptional regulator LysR family  43.89 
 
 		 303 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0288918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1429  transcriptional regulator, LysR family  43.39 
 
 		 303 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>