More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2660 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 300 aa  593  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  71.77 
 
 		 299 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  71.77 
 
 		 299 aa  424  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 299 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 299 aa  422  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  71.77 
 
 		 327 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  71.09 
 
 		 299 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  71.09 
 
 		 299 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0488  LysR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 309 aa  402  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  64.63 
 
 		 316 aa  392  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3338  transcriptional regulator, LysR family  63.55 
 
 		 301 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  58.05 
 
 		 297 aa  354  7.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 297 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  58.72 
 
 		 314 aa  351  8e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1035  transcriptional regulator, LysR family  54.33 
 
 		 303 aa  331  1e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 303 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 334 aa  316  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 303 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 334 aa  315  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 334 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 334 aa  315  8e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 334 aa  314  9e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 334 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 334 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 334 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 334 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 334 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 334 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 334 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 334 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  53.87 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  53.87 
 
 		 303 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  48.82 
 
 		 315 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 342 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 		 334 aa  309  4e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  53.2 
 
 		 303 aa  308  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 303 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 303 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2295  LysR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 338 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 335 aa  301  6.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 298 aa  301  6.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  47.81 
 
 		 314 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  47.81 
 
 		 314 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 324 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 324 aa  295  8e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 324 aa  295  9e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1410  LysR family transcriptional regulator  49 
 
 		 301 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  normal  0.531112 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  47.8 
 
 		 295 aa  291  9e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 324 aa  288  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5815  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.163492 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0812  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 309 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3062  LysR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 300 aa  281  8.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  46.26 
 
 		 435 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 415 aa  278  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  47.46 
 
 		 305 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  47.02 
 
 		 304 aa  278  6e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 428 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 299 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0176  transcriptional regulator, LysR family  48.83 
 
 		 305 aa  277  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  47.8 
 
 		 306 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 299 aa  276  3e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  46.31 
 
 		 299 aa  276  4e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3728  LysR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 297 aa  275  6e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 298 aa  275  6e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2751  transcriptional regulator, LysR family  46.08 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4263  LysR family transcriptional regulator  46 
 
 		 305 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4320  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  45.24 
 
 		 318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2403  LysR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121442  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2532  LysR family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 304 aa  271  8.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1523  transcriptional regulator, LysR family  46.49 
 
 		 308 aa  271  9e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.072714  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 324 aa  270  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1474  transcriptional regulator, LysR family  46.15 
 
 		 308 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0906205  hitchhiker  0.00000000107366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0158  LysR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 305 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3326  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 319 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.424785 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2691  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 298 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.993609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3358  transcriptional regulator, LysR family  46.78 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0114591 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3100  transcriptional regulator, LysR family  46.78 
 
 		 302 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.394543  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 301 aa  266  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3774  LysR family transcriptional regulator  42.33 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2508  LysR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2483  LysR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 309 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233033  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  45.89 
 
 		 300 aa  266  4e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0343  LysR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 301 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 340 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3011  LysR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 297 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0784  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 301 aa  265  7e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1872  LysR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 349 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>