More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1035 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1035  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 303 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  63.42 
 
 		 314 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  60.54 
 
 		 297 aa  364  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 297 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  54.83 
 
 		 299 aa  332  4e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  54.83 
 
 		 299 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  54.83 
 
 		 299 aa  332  5e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  54.08 
 
 		 327 aa  331  8e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  54.33 
 
 		 300 aa  331  1e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 299 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 299 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 299 aa  326  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  51.36 
 
 		 316 aa  317  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0812  LysR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 309 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5815  LysR family transcriptional regulator  54.18 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.163492 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3338  transcriptional regulator, LysR family  52.76 
 
 		 301 aa  308  5e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2295  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 314 aa  304  1.0000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126851 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0488  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1410  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 301 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  normal  0.531112 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1523  transcriptional regulator, LysR family  48.32 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.072714  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4263  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 303 aa  292  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3062  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 300 aa  292  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 303 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2532  LysR family transcriptional regulator  54.52 
 
 		 309 aa  291  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2403  LysR family transcriptional regulator  54.52 
 
 		 309 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121442  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  50.34 
 
 		 306 aa  290  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2483  LysR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 309 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233033  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2508  LysR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 309 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0158  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 305 aa  289  4e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 303 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 303 aa  288  8e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1872  LysR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 349 aa  288  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0176  transcriptional regulator, LysR family  47.46 
 
 		 305 aa  286  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1474  transcriptional regulator, LysR family  46.69 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0906205  hitchhiker  0.00000000107366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 303 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 303 aa  285  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  45 
 
 		 315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  45.67 
 
 		 314 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  45.67 
 
 		 314 aa  282  6.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 303 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 298 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 334 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 299 aa  276  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 338 aa  275  9e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 334 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3774  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 334 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 334 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 334 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0247  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 305 aa  269  4e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112344 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  44.07 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 334 aa  268  7e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0246  LysR family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 307 aa  268  7e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4320  LysR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 298 aa  268  8e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0248  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 305 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000146756 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0249  LysR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 334 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0246  LysR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  43.56 
 
 		 334 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0225  LysR family transcriptional regulator  45.72 
 
 		 318 aa  264  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1429  transcriptional regulator, LysR family  44.56 
 
 		 303 aa  263  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  42.37 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3011  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 297 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0910  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0269  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1156  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234191  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 342 aa  258  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1053  transcriptional regulator, LysR family  46.26 
 
 		 350 aa  257  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0343  LysR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0322  LysR family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 305 aa  256  4e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.844631 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 305 aa  255  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0255  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1685  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256836  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1773  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.790633  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1103  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130627  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0101  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1270  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.436877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>