More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2295 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2295  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 314 aa  631  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126851 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1410  LysR family transcriptional regulator  68.06 
 
 		 301 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  normal  0.531112 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0812  LysR family transcriptional regulator  69.41 
 
 		 309 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5815  LysR family transcriptional regulator  68.52 
 
 		 311 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.163492 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2403  LysR family transcriptional regulator  70.72 
 
 		 309 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121442  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2532  LysR family transcriptional regulator  70.07 
 
 		 309 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2508  LysR family transcriptional regulator  69.41 
 
 		 309 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1872  LysR family transcriptional regulator  69.41 
 
 		 349 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2483  LysR family transcriptional regulator  69.41 
 
 		 309 aa  391  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233033  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  62.01 
 
 		 297 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  62.01 
 
 		 297 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  59.22 
 
 		 314 aa  347  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3062  LysR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 299 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 299 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 299 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  53.44 
 
 		 327 aa  318  9e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  53.25 
 
 		 299 aa  317  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  52.92 
 
 		 299 aa  315  9e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  52.92 
 
 		 299 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  50.81 
 
 		 300 aa  307  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1035  transcriptional regulator, LysR family  50.65 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3338  transcriptional regulator, LysR family  50.81 
 
 		 301 aa  303  2.0000000000000002e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0488  LysR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 309 aa  302  5.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 316 aa  298  9e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  49.01 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  49 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 303 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  49 
 
 		 303 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  49 
 
 		 303 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  47.37 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0249  LysR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 307 aa  265  5e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 303 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 298 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 299 aa  264  2e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 299 aa  262  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  47.37 
 
 		 314 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  47.37 
 
 		 314 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0246  LysR family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 307 aa  261  8e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0246  LysR family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 307 aa  261  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0248  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 305 aa  260  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000146756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  47 
 
 		 303 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1523  transcriptional regulator, LysR family  44.55 
 
 		 308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.072714  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3774  LysR family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  44.95 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  43.93 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0176  transcriptional regulator, LysR family  45.48 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 334 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1053  transcriptional regulator, LysR family  46.69 
 
 		 350 aa  253  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 338 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0247  LysR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112344 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0158  LysR family transcriptional regulator  45.48 
 
 		 305 aa  251  9.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1474  transcriptional regulator, LysR family  43.41 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0906205  hitchhiker  0.00000000107366 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  42.95 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  44 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 334 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2751  transcriptional regulator, LysR family  42.57 
 
 		 305 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0225  LysR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  40.39 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  40.39 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.9 
 
 		 305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4320  LysR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 298 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1664  LysR substrate binding domain protein  40.72 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0269  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 337 aa  242  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4520  LysR family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 301 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.310402  normal  0.633071 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 298 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4062  LysR family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0198165  normal  0.373928 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3724  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 299 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0196  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00725264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3926  transcriptional regulator, LysR family  40.13 
 
 		 299 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4884  transcriptional regulator, LysR family  40.13 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3100  transcriptional regulator, LysR family  43.33 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.394543  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0455  LysR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4009  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 299 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  41.37 
 
 		 304 aa  235  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03369  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.81 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00202868  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03322  hypothetical protein  39.81 
 
 		 323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0192  transcriptional regulator, LysR family  39.81 
 
 		 323 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00370457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0910  LysR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 306 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3728  LysR family transcriptional regulator  42.43 
 
 		 297 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3825  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 323 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.18343 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0919  transcriptional regulator, LysR family protein  39.02 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 300 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>