More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_31780 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  610  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  59.8 
 
 		 298 aa  355  6.999999999999999e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  56.61 
 
 		 295 aa  346  3e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  60.07 
 
 		 305 aa  341  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2751  transcriptional regulator, LysR family  59.39 
 
 		 305 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  55 
 
 		 300 aa  332  6e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 298 aa  332  7.000000000000001e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 334 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  55.74 
 
 		 334 aa  325  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 334 aa  325  5e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 334 aa  324  9e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 334 aa  323  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 334 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 334 aa  323  2e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 334 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 334 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  54.73 
 
 		 334 aa  321  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  51.53 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 303 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 303 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 303 aa  311  9e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  54.08 
 
 		 297 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1156  LysR family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 300 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234191  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  51.86 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  51.86 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 303 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 335 aa  307  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  52.19 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 303 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3011  LysR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 297 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 338 aa  305  6e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  51.52 
 
 		 299 aa  304  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 342 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0255  LysR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 335 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1685  LysR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 335 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256836  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1773  LysR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 335 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.790633  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1429  transcriptional regulator, LysR family  50.68 
 
 		 303 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  51.7 
 
 		 297 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1270  LysR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.436877  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1103  LysR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130627  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0101  LysR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0323  LysR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1623  LysR family transcriptional regulator  53.4 
 
 		 303 aa  300  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3100  transcriptional regulator, LysR family  49.5 
 
 		 302 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.394543  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3358  transcriptional regulator, LysR family  51.52 
 
 		 302 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0114591 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0832  transcriptional regulator, LysR family  50.5 
 
 		 301 aa  296  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3443  transcriptional regulator, LysR family  50 
 
 		 300 aa  296  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2691  LysR family transcriptional regulator  52.2 
 
 		 298 aa  295  7e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.993609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3728  LysR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 297 aa  294  1e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0343  LysR family transcriptional regulator  54 
 
 		 301 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 316 aa  293  3e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4543  LysR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 304 aa  292  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110583  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 304 aa  292  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1523  transcriptional regulator, LysR family  49.15 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.072714  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  50.67 
 
 		 299 aa  290  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  47.12 
 
 		 301 aa  290  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0615  transcriptional regulator, LysR family  48.67 
 
 		 301 aa  288  6e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0885  transcriptional regulator, LysR family  51.9 
 
 		 288 aa  288  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1474  transcriptional regulator, LysR family  48.81 
 
 		 308 aa  288  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0906205  hitchhiker  0.00000000107366 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 299 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 299 aa  288  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 327 aa  288  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 309 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  48.49 
 
 		 313 aa  286  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 299 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  47.84 
 
 		 322 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0579  LysR family transcriptional regulator  48.83 
 
 		 304 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3321  transcriptional regulator, LysR family  46.53 
 
 		 306 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  51.19 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0647  LysR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 324 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  47.51 
 
 		 323 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  47.51 
 
 		 323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  47.51 
 
 		 324 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  47.51 
 
 		 324 aa  281  9e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  47.51 
 
 		 324 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3326  LysR family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.424785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 318 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1035  transcriptional regulator, LysR family  48.47 
 
 		 303 aa  280  3e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 299 aa  279  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1032  transcriptional regulator, LysR family  46.76 
 
 		 305 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  46.18 
 
 		 435 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  46.28 
 
 		 318 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 324 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 340 aa  278  1e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 428 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  46.18 
 
 		 415 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 303 aa  276  3e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3447  LysR family transcriptional regulator  46.42 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.800287  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>