More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4768 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
298 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  80.54 
 
 
298 aa  497  1e-140  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  55.22 
 
 
334 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  55.22 
 
 
334 aa  350  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
334 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  59.12 
 
 
303 aa  349  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  54.88 
 
 
334 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  55.22 
 
 
334 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  54.88 
 
 
334 aa  349  3e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  54.88 
 
 
334 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  54.88 
 
 
334 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  54.88 
 
 
334 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  54.88 
 
 
334 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  54.88 
 
 
334 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  54.88 
 
 
334 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  53.2 
 
 
334 aa  345  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3728  LysR family transcriptional regulator  57.97 
 
 
297 aa  344  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3100  transcriptional regulator, LysR family  56.42 
 
 
302 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.394543  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  53.2 
 
 
334 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  53.2 
 
 
334 aa  342  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0885  transcriptional regulator, LysR family  59.86 
 
 
288 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  53.2 
 
 
334 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  53.2 
 
 
334 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3011  LysR family transcriptional regulator  56.71 
 
 
297 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3358  transcriptional regulator, LysR family  57.09 
 
 
302 aa  338  9e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0114591 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  57.39 
 
 
314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1623  LysR family transcriptional regulator  57.73 
 
 
303 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  57.39 
 
 
314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1156  LysR family transcriptional regulator  57.59 
 
 
300 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234191  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  55.67 
 
 
315 aa  335  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1429  transcriptional regulator, LysR family  57.14 
 
 
303 aa  333  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4543  LysR family transcriptional regulator  59.11 
 
 
304 aa  334  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110583  normal  0.216629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2691  LysR family transcriptional regulator  57.04 
 
 
298 aa  332  5e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.993609  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0255  LysR family transcriptional regulator  58.28 
 
 
335 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1685  LysR family transcriptional regulator  58.28 
 
 
335 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256836  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1773  LysR family transcriptional regulator  58.28 
 
 
335 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.790633  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1103  LysR family transcriptional regulator  58.28 
 
 
351 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130627  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0323  LysR family transcriptional regulator  58.28 
 
 
351 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0101  LysR family transcriptional regulator  58.28 
 
 
351 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1270  LysR family transcriptional regulator  58.28 
 
 
351 aa  326  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.436877  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  50.85 
 
 
338 aa  324  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  54.98 
 
 
299 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  53.58 
 
 
305 aa  322  4e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0343  LysR family transcriptional regulator  58.39 
 
 
301 aa  322  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119242  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  50.85 
 
 
335 aa  321  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  51.53 
 
 
295 aa  321  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0579  LysR family transcriptional regulator  55.67 
 
 
304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.465016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0994  LysR family transcriptional regulator  56.1 
 
 
292 aa  319  3e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  52.2 
 
 
300 aa  318  7.999999999999999e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2751  transcriptional regulator, LysR family  53.24 
 
 
305 aa  316  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
303 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1015  LysR family transcriptional regulator  57.04 
 
 
311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.688296  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  51.18 
 
 
303 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  48.46 
 
 
324 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 
324 aa  310  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  47.78 
 
 
323 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 
324 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 
324 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  47.78 
 
 
323 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  48.12 
 
 
324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  48.46 
 
 
322 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  49.49 
 
 
303 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  49.16 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2167  transcriptional regulator, LysR family  50.5 
 
 
297 aa  302  6.000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
415 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
428 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  47.46 
 
 
435 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  47.96 
 
 
342 aa  300  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 
303 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  52.41 
 
 
297 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 
316 aa  299  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  51.55 
 
 
299 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  51.55 
 
 
299 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  51.55 
 
 
327 aa  299  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 
324 aa  298  9e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  51.36 
 
 
297 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  51.2 
 
 
299 aa  297  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  46.42 
 
 
304 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3449  LysR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
298 aa  296  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0784  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 
301 aa  296  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  50.67 
 
 
299 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  49.31 
 
 
299 aa  295  9e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  50.67 
 
 
299 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  48.14 
 
 
300 aa  290  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2231  LysR family transcriptional regulator  48.68 
 
 
302 aa  288  7e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  46.8 
 
 
318 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 
318 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1052  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 
299 aa  286  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.567632  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  48.82 
 
 
299 aa  285  7e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0488  LysR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
309 aa  281  8.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3447  LysR family transcriptional regulator  46.42 
 
 
305 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.800287  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1032  transcriptional regulator, LysR family  46.42 
 
 
305 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3326  LysR family transcriptional regulator  46.98 
 
 
319 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.424785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1523  transcriptional regulator, LysR family  45.42 
 
 
308 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.072714  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  47.46 
 
 
314 aa  276  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
305 aa  275  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
308 aa  275  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1474  transcriptional regulator, LysR family  44.75 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0906205  hitchhiker  0.00000000107366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>