More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3338 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3338  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 301 aa  606  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  63.55 
 
 		 300 aa  385  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  62.08 
 
 		 299 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 299 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  62.08 
 
 		 327 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  62.08 
 
 		 299 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0488  LysR family transcriptional regulator  62.71 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  61.07 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  61.41 
 
 		 299 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  61.41 
 
 		 299 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  57.82 
 
 		 316 aa  355  3.9999999999999996e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  56.04 
 
 		 314 aa  335  7.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  53.69 
 
 		 297 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  53.02 
 
 		 297 aa  326  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1035  transcriptional regulator, LysR family  52.76 
 
 		 303 aa  308  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.693724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2295  LysR family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 314 aa  303  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00126851 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5815  LysR family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 311 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.163492 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0812  LysR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 309 aa  293  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3062  LysR family transcriptional regulator  46.78 
 
 		 300 aa  289  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2483  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.233033  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2508  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 309 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1410  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 301 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00818473  normal  0.531112 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1872  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 349 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.841417  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  45.24 
 
 		 315 aa  281  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2532  LysR family transcriptional regulator  51.5 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  48.63 
 
 		 303 aa  278  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  44.56 
 
 		 295 aa  278  7e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  44.9 
 
 		 314 aa  278  9e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  44.9 
 
 		 314 aa  278  9e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2403  LysR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 309 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121442  normal  0.520067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  48.29 
 
 		 303 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 298 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 338 aa  275  7e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 334 aa  275  7e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 303 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 334 aa  272  6e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4320  LysR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 334 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 334 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 334 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 334 aa  269  5e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  43.39 
 
 		 299 aa  265  5.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  44.07 
 
 		 334 aa  265  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 323 aa  263  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  45.58 
 
 		 335 aa  261  8e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  44.33 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 299 aa  260  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3358  transcriptional regulator, LysR family  44.9 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0114591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1429  transcriptional regulator, LysR family  43.79 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2751  transcriptional regulator, LysR family  43.34 
 
 		 305 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3011  LysR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1053  transcriptional regulator, LysR family  47.92 
 
 		 350 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.969066  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4263  LysR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 305 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.467843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3728  LysR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 297 aa  258  7e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  44.25 
 
 		 306 aa  256  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  42.38 
 
 		 304 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3100  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 		 302 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.394543  normal  0.218062 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3443  transcriptional regulator, LysR family  43.3 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2691  LysR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 298 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.993609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0176  transcriptional regulator, LysR family  44.33 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.261785  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0885  transcriptional regulator, LysR family  49.65 
 
 		 288 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0994  LysR family transcriptional regulator  46.85 
 
 		 292 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0343  LysR family transcriptional regulator  45.52 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2167  transcriptional regulator, LysR family  46.05 
 
 		 297 aa  252  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.783202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1474  transcriptional regulator, LysR family  42.47 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0906205  hitchhiker  0.00000000107366 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0158  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 305 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1523  transcriptional regulator, LysR family  43.2 
 
 		 308 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.072714  normal  0.539823 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  43.79 
 
 		 300 aa  249  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  43.38 
 
 		 304 aa  249  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 300 aa  248  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1156  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.234191  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0615  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 		 301 aa  248  9e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0832  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 		 301 aa  248  9e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1024  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 298 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 305 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  41.08 
 
 		 301 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>