More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0871 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  637    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  69.03 
 
 		 340 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  68.28 
 
 		 309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  62.38 
 
 		 303 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 304 aa  398  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0322  LysR family transcriptional regulator  60.86 
 
 		 305 aa  389  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.844631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  61.64 
 
 		 304 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  62.3 
 
 		 304 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5274  LysR family transcriptional regulator  62.08 
 
 		 321 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09910  putative transcriptional regulator  60.07 
 
 		 307 aa  381  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0065  LysR family transcriptional regulator  58.39 
 
 		 302 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1024  LysR family transcriptional regulator  61.06 
 
 		 304 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2368  LysR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 313 aa  374  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2880  LysR family transcriptional regulator  59.14 
 
 		 303 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.957922  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  58.39 
 
 		 306 aa  369  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0674  transcriptional regulator, LysR family  57.43 
 
 		 315 aa  367  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6256  LysR family transcriptional regulator  58.11 
 
 		 304 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1356  transcriptional regulator, LysR family  55.66 
 
 		 314 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5951  LysR family transcriptional regulator  58.11 
 
 		 305 aa  364  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2017  LysR family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 308 aa  359  3e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.304165  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5596  transcriptional regulator, LysR family  54.55 
 
 		 308 aa  345  4e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5481  transcriptional regulator LysR family  52.36 
 
 		 303 aa  344  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0288918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0850  transcriptional regulator, LysR family  53.72 
 
 		 310 aa  343  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.840067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2438  LysR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 298 aa  341  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565253  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  53.04 
 
 		 303 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  53.04 
 
 		 303 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  53.7 
 
 		 314 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  53.7 
 
 		 314 aa  333  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 334 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  50.97 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  51.78 
 
 		 315 aa  325  6e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 334 aa  323  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 334 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 334 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 334 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3953  transcriptional regulator, LysR family  54.88 
 
 		 297 aa  318  7e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 334 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 334 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 334 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 334 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 334 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 334 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 334 aa  316  4e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 334 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 334 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2040  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 301 aa  315  8e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.141509  normal  0.369183 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 334 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 335 aa  310  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5132  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 302 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.052958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 338 aa  299  5e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2138  transcriptional regulator, LysR family  47.99 
 
 		 302 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1380  LysR family transcriptional regulator  51.2 
 
 		 297 aa  289  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 303 aa  288  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4337  LysR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 313 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  48.49 
 
 		 303 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 324 aa  285  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 303 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1665  transcriptional regulator, LysR family  43.79 
 
 		 305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0884032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  45.82 
 
 		 299 aa  282  5.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  47.3 
 
 		 435 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 415 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 428 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2480  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  45.07 
 
 		 305 aa  278  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265455  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 305 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 323 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 323 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 303 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 303 aa  275  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 318 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 300 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 297 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 303 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 305 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 324 aa  267  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 305 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  44.26 
 
 		 297 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 		 305 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2751  transcriptional regulator, LysR family  44.08 
 
 		 305 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 300 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3326  LysR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 319 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.424785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 300 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5335  transcriptional regulator, LysR family  44.48 
 
 		 301 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1032  transcriptional regulator, LysR family  42.67 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>