More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4656 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3707  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 334 aa  659    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381625  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4656  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 334 aa  659    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3814  LysR family transcriptional regulator  99.7 
 
 		 334 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204873  normal  0.412952 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2402  LysR family transcriptional regulator  87.26 
 
 		 372 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5027  LysR family transcriptional regulator  76.68 
 
 		 358 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1755  LysR family transcriptional regulator  57.52 
 
 		 318 aa  346  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000250234  normal  0.12184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4927  transcriptional regulator, LysR family  56.54 
 
 		 318 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.364408  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3326  LysR family transcriptional regulator  55.23 
 
 		 319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.424785 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 334 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 334 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 324 aa  288  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 334 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 334 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 334 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  47.77 
 
 		 334 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  46.26 
 
 		 335 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0793  LysR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 415 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0954  LysR family transcriptional regulator  47.57 
 
 		 428 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0781  transcriptional regulator  47.57 
 
 		 435 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0632  LysR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 324 aa  272  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2656  LysR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 324 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00719303  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2045  LysR family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 324 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197039  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 323 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 323 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2685  LysR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 324 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.127873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0784  LysR family transcriptional regulator  47.4 
 
 		 301 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5984  LysR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 324 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.506594  normal  0.0565131 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06550  transcriptional regulator, LysR family  45.73 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213986  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 322 aa  249  5e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  42.96 
 
 		 315 aa  248  9e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  43.64 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  43.64 
 
 		 314 aa  248  1e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5120  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3762  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 303 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3990  LysR family transcriptional regulator  44.82 
 
 		 298 aa  242  7.999999999999999e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.550501  normal  0.577869 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4040  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 303 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.466403 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5821  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 305 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3913  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 304 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1728  LysR substrate binding domain-containing protein  40.14 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1613  LysR substrate binding domain protein  40.14 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.294229  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5389  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 300 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5604  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 305 aa  235  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  44.98 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2464  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 300 aa  235  8e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.624531 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1664  LysR substrate binding domain protein  39.8 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  43.29 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  46.2 
 
 		 303 aa  232  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 305 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 304 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3873  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 300 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.15417 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4716  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 300 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.276631  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3647  LysR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 300 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.885513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  45.61 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4320  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0196  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00725264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3583  transcriptional regulator, LysR family  42.37 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.23323  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3724  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4884  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 323 aa  225  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0832  transcriptional regulator, LysR family  39.4 
 
 		 301 aa  225  9e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 305 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3926  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.711763  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4009  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 299 aa  223  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3825  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.18343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  39.66 
 
 		 295 aa  223  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 313 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4337  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 313 aa  222  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03369  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.73 
 
 		 323 aa  222  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00202868  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0192  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 323 aa  222  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00370457  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03322  hypothetical protein  39.73 
 
 		 323 aa  222  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00215275  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1024  LysR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3447  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.800287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1032  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.156305 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  40.34 
 
 		 306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 299 aa  220  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 297 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2691  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.993609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0800  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 303 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.440519 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0885  transcriptional regulator, LysR family  44.44 
 
 		 288 aa  218  7.999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4768  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.320291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>