More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1294 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1294  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3340  transcriptional regulator, LysR family  62.89 
 
 		 299 aa  382  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.659318 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4471  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 300 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190503  normal  0.801309 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1262  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 300 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.414477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4582  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 303 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00622026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5723  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 303 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210573 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3786  LysR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 303 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4009  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.270978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1564  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 343 aa  192  6e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0571861  normal  0.229966 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0123  transcriptional regulator  37 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2460  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 301 aa  179  4.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.367716 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2989  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.061408 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_003296  RS05458  transcription regulator protein  37.11 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2575  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 301 aa  168  8e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4592  LysR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 313 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1652  LysR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 302 aa  165  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.4 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 304 aa  162  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3570  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 310 aa  162  6e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6125  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.36 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479061  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  34.47 
 
 		 298 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3549  LyrR family transcriptional regulator  34 
 
 		 299 aa  162  9e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  33.68 
 
 		 305 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  33.9 
 
 		 300 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4256  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5917  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5552  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6421  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 305 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3214  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397323 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4337  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0980  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 304 aa  159  7e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.926396 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 306 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 305 aa  159  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5503  transcriptional regulator, LysR family  32.57 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4334  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1475  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 325 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2006  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.126264  normal  0.0111016 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5774  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  31.53 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2964  transcriptional regulator, LysR family  34.98 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2774  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1087  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 316 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  32.42 
 
 		 335 aa  155  6e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0670  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6743  transcriptional regulator, LysR family  33.78 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796721 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  31.96 
 
 		 289 aa  155  8e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  34.46 
 
 		 293 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1221  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678817  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5534  LysR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2108  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 334 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 306 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0984  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 300 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4938  LysR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3222  LysR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3332  transcription regulator protein  34.35 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4882  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000927  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 334 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2214  LysR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000844726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6112  transcriptional regulator  34.36 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2436  LysR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 337 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399633  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  32.53 
 
 		 303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4932  LysR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  hitchhiker  0.000452081 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2356  transcriptional regulator, LysR family  30.77 
 
 		 307 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118407  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  31.86 
 
 		 297 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 334 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3304  transcriptional regulator, LysR family  36.52 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406781  hitchhiker  0.00949003 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4581  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6067  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 		 294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  32.31 
 
 		 315 aa  152  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  30.93 
 
 		 301 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1468  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1838  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0825  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 334 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>