More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2575 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_2575  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2697  transcriptional regulator, LysR family  39.12 
 
 		 300 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0542  transcription regulator protein  41.31 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0670  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3680  transcriptional regulator, LysR family  40.99 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2366  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2214  LysR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000844726  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1660  transcriptional regulator, LysR family  45.88 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0094894  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1733  transcriptional regulator, LysR family  45.58 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0522  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05458  transcription regulator protein  41.64 
 
 		 298 aa  203  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.106527 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2132  transcriptional regulator, LysR family  41.87 
 
 		 298 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0551  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 299 aa  202  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  38.95 
 
 		 307 aa  201  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0437  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 		 305 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.704934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2006  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 290 aa  199  6e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.126264  normal  0.0111016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0423  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  hitchhiker  0.000106922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  40.28 
 
 		 306 aa  196  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  37.19 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6327  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 291 aa  191  9e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4311  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  40 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 302 aa  189  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1704  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 301 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.743789  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5388  LysR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.14883 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3870  putative transcriptional regulator  38.52 
 
 		 289 aa  188  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.618692 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5474  LysR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 297 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2452  LysR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4882  LysR family transcriptional regulator  39.49 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0474  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2575  transcriptional regulator, LysR family  39.08 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0931431  normal  0.61434 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3304  transcriptional regulator, LysR family  39.21 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406781  hitchhiker  0.00949003 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_003296  RS00906  transcription regulator protein  37.8 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.440828 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2292  LysR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 299 aa  186  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2603  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 555 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1070  transcriptional regulator, LysR family  36.01 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651506  decreased coverage  0.00634214 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2062  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  hitchhiker  0.00696993 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000050  transcriptional regulator LysR family  37.81 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.385466  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0517  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2663  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0493  LysR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 291 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  36.9 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1970  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 399 aa  182  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2482  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1743  carbonate dehydratase  34.81 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 305 aa  181  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3712  LysR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1650  transcriptional regulator, LysR family  39.29 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  35.69 
 
 		 307 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 303 aa  180  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6125  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.86 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.479061  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2190  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 		 304 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0283977  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1199  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  35.11 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 302 aa  179  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 298 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7085  LysR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 295 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 314 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1395  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 301 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.465042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 294 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 298 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 294 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 306 aa  178  8e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3332  transcription regulator protein  40.58 
 
 		 298 aa  178  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  37.99 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1994  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 305 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3576  carbonate dehydratase  34.46 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4613  transcriptional regulator, LysR family  36.55 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1355  LysR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3299  transcriptional regulator, LysR family  41.89 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244335  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2671  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0984  LysR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0583  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0677  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50600  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 304 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.857605  normal  0.0631781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>