More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_16720 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  603  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2899  transcriptional regulator, LysR family  70.57 
 
 		 301 aa  443  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0977536  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0546  LysR family transcriptional regulator  73.91 
 
 		 304 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.921789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2930  LysR family transcriptional regulator  66.44 
 
 		 301 aa  411  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3053  LysR family transcriptional regulator  68.46 
 
 		 311 aa  411  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  65.44 
 
 		 301 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3612  transcriptional regulator, LysR family  54.36 
 
 		 307 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.155028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  51.19 
 
 		 305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23700  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 303 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2909  transcriptional regulator, LysR family  50.34 
 
 		 320 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 301 aa  257  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2431  LysR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 312 aa  256  4e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2550  transcriptional regulator, LysR family  48.44 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.673699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2809  transcriptional regulator, LysR family  49.48 
 
 		 300 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1596  transcriptional regulator, LysR family  51.38 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3183  LysR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224527  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2734  LysR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 303 aa  249  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4251  LysR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 312 aa  248  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2534  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 299 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.487932  normal  0.277262 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1155  LysR substrate binding domain-containing protein  48.31 
 
 		 349 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0995  LysR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 349 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291336  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2019  LysR family transcriptional regulator  45.42 
 
 		 296 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0873  LysR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 320 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493245  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1002  LysR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 320 aa  245  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0275  LysR family transcriptional regulator  48.31 
 
 		 320 aa  245  6e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0952  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3506  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0139  LysR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 301 aa  228  8e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154099 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0776  LysR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0799  LysR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3595  transcriptional regulator, LysR family  47.75 
 
 		 317 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4655  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 313 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3664  transcriptional regulator, LysR family  47.28 
 
 		 317 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4660  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4522  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.275616  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 302 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 320 aa  215  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1181  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 299 aa  212  7e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0719  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3400  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0212  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0203  transcriptional regulator, LysR family  37.46 
 
 		 304 aa  208  7e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00201  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.11 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0488817  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0221  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0884179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3457  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.451664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35920  Regulatory protein, LysR family  44.56 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00206  hypothetical protein  37.11 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0219  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0947098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 306 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  40.48 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1221  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678817  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0294  LysR substrate binding domain-containing protein  37.11 
 
 		 304 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 305 aa  206  4e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0212  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0286  LysR substrate binding domain protein  37.46 
 
 		 304 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0300  LysR substrate binding domain protein  37.11 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0329  transcriptional regulator, LysR family  38.19 
 
 		 298 aa  205  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4145  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  39.72 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0279  LysR substrate binding domain-containing protein  36.77 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0321  transcriptional regulator, LysR family  39.08 
 
 		 298 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0742  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0281  LysR substrate binding domain protein  37.11 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0905  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 295 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  35.49 
 
 		 302 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40440  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2095  LysR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.764255  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11490  Transcriptional regulator, LysR family  43.34 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 327 aa  199  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 327 aa  199  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 300 aa  199  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3214  transcriptional regulator, LysR family  42.36 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00397323 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3430  transcriptional regulator, LysR family  40.83 
 
 		 330 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  37.06 
 
 		 307 aa  198  7.999999999999999e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 327 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  38.91 
 
 		 297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42060  LysR family regulatory protein  36.21 
 
 		 295 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0994  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5139  LysR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.528058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1434  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325668  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 305 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1152  transcription regulator protein  40.68 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311486  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1090  transcriptional regulator, LysR family  39.32 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 309 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3431  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>