More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3595 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3595  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
317 aa  603  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3664  transcriptional regulator, LysR family  97.48 
 
 
317 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3506  LysR family transcriptional regulator  85.35 
 
 
319 aa  508  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23700  LysR family transcriptional regulator  57.29 
 
 
303 aa  325  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0115342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  57.29 
 
 
305 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2909  transcriptional regulator, LysR family  55.08 
 
 
320 aa  315  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2734  LysR family transcriptional regulator  54.58 
 
 
303 aa  306  3e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2550  transcriptional regulator, LysR family  54.05 
 
 
300 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.673699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2809  transcriptional regulator, LysR family  53.51 
 
 
300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4251  LysR family transcriptional regulator  51.85 
 
 
312 aa  285  5e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1596  transcriptional regulator, LysR family  54.42 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0995  LysR family transcriptional regulator  50.96 
 
 
349 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1155  LysR substrate binding domain-containing protein  50.96 
 
 
349 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1002  LysR family transcriptional regulator  50.96 
 
 
320 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0275  LysR family transcriptional regulator  50.96 
 
 
320 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0873  LysR family transcriptional regulator  50.96 
 
 
320 aa  278  8e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  52.05 
 
 
301 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35920  Regulatory protein, LysR family  52.36 
 
 
304 aa  272  6e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0952  LysR family transcriptional regulator  50.32 
 
 
317 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0799  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 
320 aa  268  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  51.68 
 
 
310 aa  264  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2431  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 
312 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3053  LysR family transcriptional regulator  47.59 
 
 
311 aa  252  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  48.26 
 
 
301 aa  245  9e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2534  LysR family transcriptional regulator  48.83 
 
 
299 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.487932  normal  0.277262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3183  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 
299 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224527  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5139  LysR family transcriptional regulator  51.02 
 
 
300 aa  241  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.528058  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2019  LysR family transcriptional regulator  50.35 
 
 
296 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213038  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3612  transcriptional regulator, LysR family  47.42 
 
 
307 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.155028 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2899  transcriptional regulator, LysR family  45.67 
 
 
301 aa  237  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0977536  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2930  LysR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5950  LysR family transcriptional regulator  46.69 
 
 
321 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  47.75 
 
 
300 aa  231  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0139  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
301 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0154099 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0546  LysR family transcriptional regulator  47.75 
 
 
304 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.921789  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0776  LysR family transcriptional regulator  41.4 
 
 
298 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4660  LysR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
298 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0719  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
303 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4655  LysR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
313 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4522  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
298 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.275616  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0329  transcriptional regulator, LysR family  38.19 
 
 
298 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  40.83 
 
 
304 aa  202  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0209  transcriptional regulator, LysR family protein  41.46 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0321  transcriptional regulator, LysR family  39.24 
 
 
298 aa  200  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  40.95 
 
 
320 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2455  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
293 aa  199  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  45.52 
 
 
298 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  40.84 
 
 
304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0212  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
304 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00206756  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2389  LysR family transcriptional regulator  38.68 
 
 
293 aa  196  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3613  transcriptional regulator, LysR family  40.75 
 
 
298 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.901661  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3400  transcriptional regulator, LysR family  37.25 
 
 
304 aa  195  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0212  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
304 aa  195  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00201  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.25 
 
 
304 aa  195  9e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0488817  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00206  hypothetical protein  37.25 
 
 
304 aa  195  9e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3457  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
304 aa  195  9e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.451664  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 
299 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0221  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
304 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0884179  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3598  LysR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
293 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0203  transcriptional regulator, LysR family  36.91 
 
 
304 aa  193  3e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0219  transcriptional regulator, LysR family  37.25 
 
 
304 aa  193  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0947098  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
302 aa  193  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2948  LysR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
298 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00477903  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3430  transcriptional regulator, LysR family  41.85 
 
 
330 aa  192  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0300  LysR substrate binding domain protein  36.67 
 
 
304 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0294  LysR substrate binding domain-containing protein  36.67 
 
 
304 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1529  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 
298 aa  191  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205298  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  41.44 
 
 
305 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0279  LysR substrate binding domain-containing protein  36.33 
 
 
304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3431  putative transcriptional regulator  38.95 
 
 
327 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1090  transcriptional regulator, LysR family  41.1 
 
 
298 aa  190  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  46.34 
 
 
302 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  46.34 
 
 
302 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  46.34 
 
 
302 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  40.2 
 
 
309 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  39.32 
 
 
300 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0286  LysR substrate binding domain protein  37 
 
 
304 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02796  putative transcriptional regulator, LysR family protein  38.97 
 
 
299 aa  189  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40440  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 
295 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0742  LysR family transcriptional regulator  39.51 
 
 
300 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3771  transcriptional regulator, LysR family  38.41 
 
 
298 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
301 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1221  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
309 aa  186  3e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678817  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0994  transcriptional regulator, LysR family  40.75 
 
 
298 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3897  transcriptional regulator, LysR family  44.48 
 
 
300 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.514135  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
304 aa  186  5e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5787  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 
308 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1818  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
297 aa  185  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0281  LysR substrate binding domain protein  36.33 
 
 
304 aa  185  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 
342 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
301 aa  185  9e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1696  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
308 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  36.18 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 
301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0285  LysR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4862  LysR family transcriptional regulator  41.97 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0796  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.226642 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>