More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2948 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2948  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00477903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1529  transcriptional regulator, LysR family  97.32 
 
 		 298 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3431  putative transcriptional regulator  60.14 
 
 		 327 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40440  LysR family transcriptional regulator  58.78 
 
 		 295 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0994  transcriptional regulator, LysR family  61.15 
 
 		 298 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1090  transcriptional regulator, LysR family  61.15 
 
 		 298 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1152  transcription regulator protein  60.81 
 
 		 297 aa  352  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311486  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4262  LysR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 298 aa  341  8e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.932976  decreased coverage  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0719  LysR family transcriptional regulator  55.74 
 
 		 303 aa  334  1e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0285  LysR family transcriptional regulator  61.82 
 
 		 298 aa  334  1e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0776  LysR family transcriptional regulator  55.37 
 
 		 298 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4522  LysR family transcriptional regulator  55.37 
 
 		 298 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.275616  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4660  LysR family transcriptional regulator  55.37 
 
 		 298 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1181  LysR family transcriptional regulator  52.74 
 
 		 299 aa  322  4e-87  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4655  LysR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 313 aa  322  5e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0321  transcriptional regulator, LysR family  55.63 
 
 		 298 aa  319  3e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0329  transcriptional regulator, LysR family  53.72 
 
 		 298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0944  LysR family transcriptional regulator  56.76 
 
 		 297 aa  315  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5574  LysR family transcriptional regulator  56.57 
 
 		 300 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5365  putative LysR family transcriptional regulator  56.85 
 
 		 300 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5117  LysR family transcriptional regulator  56.51 
 
 		 300 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4672  LysR family transcriptional regulator  54.21 
 
 		 300 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3897  transcriptional regulator, LysR family  56.66 
 
 		 300 aa  304  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.514135  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2800  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0067  LysR family transcriptional regulator  56.42 
 
 		 302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4749  LysR family transcriptional regulator  56.85 
 
 		 314 aa  301  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5294  LysR family transcriptional regulator  56.51 
 
 		 314 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5711  LysR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6075  LysR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3771  transcriptional regulator, LysR family  52.36 
 
 		 298 aa  300  3e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0420  transcriptional regulator  56.51 
 
 		 343 aa  299  5e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0660  LysR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 303 aa  297  1e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3613  transcriptional regulator, LysR family  51.68 
 
 		 298 aa  296  2e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.901661  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6559  LysR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 300 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.379157 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2155  LysR family transcriptional regulator  56.16 
 
 		 308 aa  296  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4004  LysR family transcriptional regulator  57.09 
 
 		 295 aa  297  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3353  LysR family transcriptional regulator  56.51 
 
 		 315 aa  296  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0979996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0241  LysR family transcriptional regulator  55.48 
 
 		 313 aa  296  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5408  LysR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 314 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5454  LysR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 314 aa  295  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900214  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4862  LysR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 313 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0579  LysR family substrate binding transcriptional regulator  54.36 
 
 		 303 aa  295  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3598  LysR family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 293 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0278  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  54.36 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0905  LysR family transcriptional regulator  49.66 
 
 		 295 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2389  LysR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 293 aa  290  2e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2455  LysR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 293 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02796  putative transcriptional regulator, LysR family protein  47.54 
 
 		 299 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0209  transcriptional regulator, LysR family protein  49.33 
 
 		 293 aa  280  3e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3400  transcriptional regulator, LysR family  43.43 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0279  LysR substrate binding domain-containing protein  44.78 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0212  LysR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00201  predicted DNA-binding transcriptional regulator  42.76 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0488817  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00206  hypothetical protein  42.76 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3457  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 304 aa  262  4.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.451664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0203  transcriptional regulator, LysR family  43.1 
 
 		 304 aa  262  6e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0212  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 304 aa  261  8e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00206756  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0221  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0884179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0219  transcriptional regulator, LysR family  42.76 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0947098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0281  LysR substrate binding domain protein  43.77 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0286  LysR substrate binding domain protein  43.77 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0294  LysR substrate binding domain-containing protein  43.77 
 
 		 304 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0742  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 300 aa  259  4e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0300  LysR substrate binding domain protein  43.77 
 
 		 304 aa  258  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2705  regulatory protein, LysR  42.29 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2550  transcriptional regulator, LysR family  43.05 
 
 		 300 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.673699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2809  transcriptional regulator, LysR family  41.02 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23700  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115342 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3612  transcriptional regulator, LysR family  40.21 
 
 		 307 aa  202  4e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.155028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3506  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 319 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2534  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 299 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.487932  normal  0.277262 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2734  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3183  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 299 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224527  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2899  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0977536  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2019  LysR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 296 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2909  transcriptional regulator, LysR family  39.38 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4251  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2431  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 312 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3053  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 311 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2408  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0423159  normal  0.525947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 301 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1596  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3595  transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 		 317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  36.03 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1221  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 309 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678817  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2930  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 320 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3062  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.36 
 
 		 298 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3664  transcriptional regulator, LysR family  40.34 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0546  LysR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.921789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 303 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35920  Regulatory protein, LysR family  38.14 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34690  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 297 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0262778  normal  0.106193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2944  putative transcriptional regulator  36.68 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0995  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 349 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>