More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5117 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5117  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5365  putative LysR family transcriptional regulator  87.96 
 
 		 300 aa  505  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4749  LysR family transcriptional regulator  72.7 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5294  LysR family transcriptional regulator  72.35 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4862  LysR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 313 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5408  LysR family transcriptional regulator  71.33 
 
 		 314 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5574  LysR family transcriptional regulator  70.47 
 
 		 300 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5454  LysR family transcriptional regulator  71.33 
 
 		 314 aa  387  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900214  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3353  LysR family transcriptional regulator  72.16 
 
 		 315 aa  384  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0979996 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0241  LysR family transcriptional regulator  69.9 
 
 		 313 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2155  LysR family transcriptional regulator  71.43 
 
 		 308 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0420  transcriptional regulator  70.41 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0994  transcriptional regulator, LysR family  65.05 
 
 		 298 aa  371  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1152  transcription regulator protein  65.51 
 
 		 297 aa  369  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311486  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1090  transcriptional regulator, LysR family  65.74 
 
 		 298 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4262  LysR family transcriptional regulator  66.78 
 
 		 298 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.932976  decreased coverage  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40440  LysR family transcriptional regulator  60.54 
 
 		 295 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0285  LysR family transcriptional regulator  65.42 
 
 		 298 aa  358  9e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3431  putative transcriptional regulator  60.2 
 
 		 327 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0067  LysR family transcriptional regulator  65.08 
 
 		 302 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0660  LysR family transcriptional regulator  63.51 
 
 		 303 aa  345  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0579  LysR family substrate binding transcriptional regulator  63.85 
 
 		 303 aa  342  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0278  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  63.85 
 
 		 303 aa  342  4e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0776  LysR family transcriptional regulator  59.17 
 
 		 298 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4522  LysR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 298 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.275616  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0329  transcriptional regulator, LysR family  54.7 
 
 		 298 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3613  transcriptional regulator, LysR family  57.38 
 
 		 298 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.901661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3771  transcriptional regulator, LysR family  57.05 
 
 		 298 aa  339  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3897  transcriptional regulator, LysR family  60.4 
 
 		 300 aa  338  4e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.514135  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4660  LysR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 298 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0321  transcriptional regulator, LysR family  55.37 
 
 		 298 aa  338  8e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0944  LysR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 297 aa  337  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2948  LysR family transcriptional regulator  56.51 
 
 		 298 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00477903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1181  LysR family transcriptional regulator  53.18 
 
 		 299 aa  334  1e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4655  LysR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 313 aa  332  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1529  transcriptional regulator, LysR family  55.82 
 
 		 298 aa  332  4e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0719  LysR family transcriptional regulator  56.75 
 
 		 303 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6075  LysR family transcriptional regulator  58.48 
 
 		 300 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5711  LysR family transcriptional regulator  58.48 
 
 		 300 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6559  LysR family transcriptional regulator  58.13 
 
 		 300 aa  321  8e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.379157 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4672  LysR family transcriptional regulator  58.48 
 
 		 300 aa  316  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4004  LysR family transcriptional regulator  60.9 
 
 		 295 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2455  LysR family transcriptional regulator  50.86 
 
 		 293 aa  301  7.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2800  LysR family transcriptional regulator  53.29 
 
 		 291 aa  294  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111359  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0209  transcriptional regulator, LysR family protein  50.17 
 
 		 293 aa  291  8e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3598  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 293 aa  290  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2389  LysR family transcriptional regulator  48.45 
 
 		 293 aa  290  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0905  LysR family transcriptional regulator  48.14 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0279  LysR substrate binding domain-containing protein  47.81 
 
 		 304 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0294  LysR substrate binding domain-containing protein  47.81 
 
 		 304 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0300  LysR substrate binding domain protein  47.81 
 
 		 304 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00201  predicted DNA-binding transcriptional regulator  46.8 
 
 		 304 aa  275  6e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0488817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3457  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 304 aa  275  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.451664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00206  hypothetical protein  46.8 
 
 		 304 aa  275  6e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3400  transcriptional regulator, LysR family  46.8 
 
 		 304 aa  275  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0212  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 304 aa  275  7e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0212  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 304 aa  275  9e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0219  transcriptional regulator, LysR family  46.8 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0947098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0221  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0884179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0203  transcriptional regulator, LysR family  46.46 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0286  LysR substrate binding domain protein  47.14 
 
 		 304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0742  LysR family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0281  LysR substrate binding domain protein  46.8 
 
 		 304 aa  271  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02796  putative transcriptional regulator, LysR family protein  45.92 
 
 		 299 aa  262  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2705  regulatory protein, LysR  42.55 
 
 		 286 aa  255  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3183  LysR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224527  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2019  LysR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213038  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2534  LysR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.487932  normal  0.277262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23700  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  41.11 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2550  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.673699 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2734  LysR family transcriptional regulator  40.64 
 
 		 303 aa  198  7.999999999999999e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2899  transcriptional regulator, LysR family  37.97 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0977536  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3595  transcriptional regulator, LysR family  41.4 
 
 		 317 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3506  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4251  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 312 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2809  transcriptional regulator, LysR family  38.87 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2909  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 320 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3664  transcriptional regulator, LysR family  40.48 
 
 		 317 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2431  LysR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 303 aa  186  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1596  transcriptional regulator, LysR family  38.75 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 293 aa  183  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 300 aa  182  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 303 aa  181  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6245  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3304  transcriptional regulator, LysR family  38.24 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0406781  hitchhiker  0.00949003 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 306 aa  179  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2085  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 301 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35920  Regulatory protein, LysR family  43.33 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1356  LysR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3053  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 311 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>