More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4251 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4251  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 312 aa  627  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2909  transcriptional regulator, LysR family  69.93 
 
 		 320 aa  412  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23700  LysR family transcriptional regulator  63.09 
 
 		 303 aa  378  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  59.93 
 
 		 305 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2734  LysR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 303 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2550  transcriptional regulator, LysR family  57.38 
 
 		 300 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.673699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2809  transcriptional regulator, LysR family  58.39 
 
 		 300 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1596  transcriptional regulator, LysR family  59.73 
 
 		 305 aa  335  7.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1155  LysR substrate binding domain-containing protein  53.24 
 
 		 349 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0995  LysR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 349 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291336  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0275  LysR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 320 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0873  LysR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 320 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493245  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1002  LysR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 320 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3506  LysR family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 319 aa  302  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0952  LysR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 317 aa  299  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0799  LysR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 320 aa  287  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5950  LysR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3595  transcriptional regulator, LysR family  52.22 
 
 		 317 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3664  transcriptional regulator, LysR family  52.04 
 
 		 317 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3183  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 299 aa  279  5e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224527  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2019  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 296 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35920  Regulatory protein, LysR family  50 
 
 		 304 aa  276  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2431  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 312 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2534  LysR family transcriptional regulator  49.13 
 
 		 299 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.487932  normal  0.277262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  49 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  49.31 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2899  transcriptional regulator, LysR family  47.24 
 
 		 301 aa  266  2e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0977536  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2930  LysR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 301 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3053  LysR family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0139  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154099 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  48.62 
 
 		 300 aa  256  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0546  LysR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.921789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5139  LysR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.528058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3612  transcriptional regulator, LysR family  45.52 
 
 		 307 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.155028 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 320 aa  228  7e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0776  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 298 aa  228  9e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0719  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4522  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.275616  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4655  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4660  LysR family transcriptional regulator  41.52 
 
 		 298 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0321  transcriptional regulator, LysR family  41.16 
 
 		 298 aa  219  7e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0329  transcriptional regulator, LysR family  39.8 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3431  putative transcriptional regulator  41.16 
 
 		 327 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40440  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 295 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3430  transcriptional regulator, LysR family  44.15 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  41.22 
 
 		 309 aa  205  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2711  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 304 aa  202  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1152  transcription regulator protein  42.61 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311486  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2948  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 298 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00477903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1529  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6256  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 304 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1221  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678817  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0994  transcriptional regulator, LysR family  42.16 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1090  transcriptional regulator, LysR family  41.81 
 
 		 298 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0209  transcriptional regulator, LysR family protein  40.07 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3771  transcriptional regulator, LysR family  39.18 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0905  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09910  putative transcriptional regulator  38.33 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5951  LysR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  39.06 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5274  LysR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 321 aa  192  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2455  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 293 aa  191  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1356  transcriptional regulator, LysR family  38.08 
 
 		 314 aa  191  9e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4702  transcriptional regulator, LysR family  38.46 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0871  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 313 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00440392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  39.93 
 
 		 293 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0847  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 334 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307439 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 334 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2368  LysR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 313 aa  187  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3371  LysR family transcriptional regulator  36.66 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3613  transcriptional regulator, LysR family  38.95 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.901661  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5846  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 324 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5232  LysR family transcriptional regulator  36.66 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4701  LysR family transcriptional regulator  36.66 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.186388  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4262  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 298 aa  187  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.932976  decreased coverage  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4532  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 334 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2889  LysR family transcriptional regulator  37.54 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02796  putative transcriptional regulator, LysR family protein  37.63 
 
 		 299 aa  186  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7021  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.0705694 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 301 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5787  transcriptional regulator, LysR family  39.34 
 
 		 308 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6355  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1473  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 305 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0127163  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0414  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 334 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2142  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 334 aa  185  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0511  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 334 aa  185  9e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 301 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>