More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2550 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2550  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 300 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.673699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2809  transcriptional regulator, LysR family  92 
 
 		 300 aa  560  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2734  LysR family transcriptional regulator  67 
 
 		 303 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  62.08 
 
 		 305 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23700  LysR family transcriptional regulator  61.74 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2909  transcriptional regulator, LysR family  60.61 
 
 		 320 aa  353  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1596  transcriptional regulator, LysR family  59 
 
 		 305 aa  342  4e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4251  LysR family transcriptional regulator  57.38 
 
 		 312 aa  332  4e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3506  LysR family transcriptional regulator  53.18 
 
 		 319 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5139  LysR family transcriptional regulator  58.45 
 
 		 300 aa  296  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.528058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1155  LysR substrate binding domain-containing protein  52.01 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3595  transcriptional regulator, LysR family  54.05 
 
 		 317 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0275  LysR family transcriptional regulator  52.01 
 
 		 320 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0873  LysR family transcriptional regulator  52.01 
 
 		 320 aa  293  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493245  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0995  LysR family transcriptional regulator  52.01 
 
 		 349 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1002  LysR family transcriptional regulator  52.01 
 
 		 320 aa  293  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3664  transcriptional regulator, LysR family  54.05 
 
 		 317 aa  291  8e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35920  Regulatory protein, LysR family  52.51 
 
 		 304 aa  288  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0952  LysR family transcriptional regulator  51.34 
 
 		 317 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0799  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 320 aa  275  6e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5950  LysR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3053  LysR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 311 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 310 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2899  transcriptional regulator, LysR family  47.28 
 
 		 301 aa  257  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0977536  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2930  LysR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 301 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  48.26 
 
 		 301 aa  256  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 300 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3183  LysR family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 299 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224527  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 301 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2019  LysR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2431  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2534  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 299 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.487932  normal  0.277262 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0546  LysR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 304 aa  231  8.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.921789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0719  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 303 aa  229  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3612  transcriptional regulator, LysR family  45.92 
 
 		 307 aa  228  8e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.155028 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0139  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 301 aa  227  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154099 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0321  transcriptional regulator, LysR family  40.91 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1529  transcriptional regulator, LysR family  42.37 
 
 		 298 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2948  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00477903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0329  transcriptional regulator, LysR family  40.91 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4655  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0776  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 298 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4660  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 298 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4522  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 298 aa  218  7e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.275616  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 304 aa  209  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1221  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 309 aa  208  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678817  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3613  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.901661  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40440  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 295 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3771  transcriptional regulator, LysR family  40 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0994  transcriptional regulator, LysR family  41.38 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1696  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3431  putative transcriptional regulator  40.68 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1152  transcription regulator protein  42.31 
 
 		 297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311486  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3598  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1090  transcriptional regulator, LysR family  40.69 
 
 		 298 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3400  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0212  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2455  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2389  LysR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 293 aa  192  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 300 aa  192  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 299 aa  192  6e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 297 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00201  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.76 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0488817  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0905  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 295 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3457  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.451664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00206  hypothetical protein  37.76 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0221  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0884179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 342 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0203  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0219  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 304 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0947098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0209  transcriptional regulator, LysR family protein  37.25 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0212  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00206756  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 300 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 307 aa  188  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2577  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 323 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0641  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 322 aa  188  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2703  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 323 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00402588  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4278  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 312 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.105517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0300  LysR substrate binding domain protein  37.76 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3430  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0294  LysR substrate binding domain-containing protein  37.76 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>