More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3431 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3431  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 327 aa  661    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40440  LysR family transcriptional regulator  94.24 
 
 		 295 aa  564  1e-160  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4660  LysR family transcriptional regulator  71.09 
 
 		 298 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0719  LysR family transcriptional regulator  72.54 
 
 		 303 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4522  LysR family transcriptional regulator  70.75 
 
 		 298 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.275616  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4655  LysR family transcriptional regulator  68.23 
 
 		 313 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0776  LysR family transcriptional regulator  67.69 
 
 		 298 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1090  transcriptional regulator, LysR family  62.59 
 
 		 298 aa  358  6e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0994  transcriptional regulator, LysR family  62.24 
 
 		 298 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2948  LysR family transcriptional regulator  60.14 
 
 		 298 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00477903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0321  transcriptional regulator, LysR family  59.39 
 
 		 298 aa  355  6.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1529  transcriptional regulator, LysR family  59.12 
 
 		 298 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205298  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1152  transcription regulator protein  62.24 
 
 		 297 aa  354  1e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311486  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0329  transcriptional regulator, LysR family  58.36 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3771  transcriptional regulator, LysR family  60.07 
 
 		 298 aa  350  2e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4262  LysR family transcriptional regulator  63.05 
 
 		 298 aa  350  3e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.932976  decreased coverage  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0067  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 302 aa  346  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0944  LysR family transcriptional regulator  60.68 
 
 		 297 aa  346  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0285  LysR family transcriptional regulator  62.93 
 
 		 298 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3613  transcriptional regulator, LysR family  58.5 
 
 		 298 aa  342  4e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.901661  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0660  LysR family transcriptional regulator  63.48 
 
 		 303 aa  342  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0579  LysR family substrate binding transcriptional regulator  63.82 
 
 		 303 aa  341  1e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0278  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  63.82 
 
 		 303 aa  340  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5365  putative LysR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 300 aa  333  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5574  LysR family transcriptional regulator  59.45 
 
 		 300 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5117  LysR family transcriptional regulator  60.2 
 
 		 300 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0241  LysR family transcriptional regulator  58.98 
 
 		 313 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4862  LysR family transcriptional regulator  57.63 
 
 		 313 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0420  transcriptional regulator  57.53 
 
 		 343 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5294  LysR family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4749  LysR family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2155  LysR family transcriptional regulator  57.97 
 
 		 308 aa  319  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1181  LysR family transcriptional regulator  51.86 
 
 		 299 aa  318  6e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5454  LysR family transcriptional regulator  58.13 
 
 		 314 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900214  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5408  LysR family transcriptional regulator  58.13 
 
 		 314 aa  318  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3353  LysR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 315 aa  315  8e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0979996 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0209  transcriptional regulator, LysR family protein  53.22 
 
 		 293 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3598  LysR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 293 aa  309  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3897  transcriptional regulator, LysR family  57.09 
 
 		 300 aa  308  5.9999999999999995e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.514135  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4672  LysR family transcriptional regulator  57 
 
 		 300 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2389  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 293 aa  308  9e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4004  LysR family transcriptional regulator  58.36 
 
 		 295 aa  306  3e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2455  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 		 293 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2800  LysR family transcriptional regulator  51.88 
 
 		 291 aa  299  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111359  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6075  LysR family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 300 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5711  LysR family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 300 aa  298  6e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6559  LysR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 300 aa  295  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.379157 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0905  LysR family transcriptional regulator  48.64 
 
 		 295 aa  292  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0279  LysR substrate binding domain-containing protein  48.46 
 
 		 304 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02796  putative transcriptional regulator, LysR family protein  47.99 
 
 		 299 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0203  transcriptional regulator, LysR family  47.77 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0219  transcriptional regulator, LysR family  47.77 
 
 		 304 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0947098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0294  LysR substrate binding domain-containing protein  48.12 
 
 		 304 aa  282  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0221  LysR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 304 aa  282  6.000000000000001e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0884179  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3400  transcriptional regulator, LysR family  47.08 
 
 		 304 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0212  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 304 aa  282  7.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00201  predicted DNA-binding transcriptional regulator  47.08 
 
 		 304 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0488817  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3457  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 304 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.451664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00206  hypothetical protein  47.08 
 
 		 304 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0300  LysR substrate binding domain protein  48.12 
 
 		 304 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0286  LysR substrate binding domain protein  47.78 
 
 		 304 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0212  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00206756  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0281  LysR substrate binding domain protein  47.44 
 
 		 304 aa  278  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0742  LysR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2705  regulatory protein, LysR  39.72 
 
 		 286 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23700  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 303 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  42.28 
 
 		 305 aa  216  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2734  LysR family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 303 aa  209  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3053  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 311 aa  208  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3183  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224527  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2534  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 299 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.487932  normal  0.277262 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2909  transcriptional regulator, LysR family  41.84 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1596  transcriptional regulator, LysR family  42.36 
 
 		 305 aa  202  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35920  Regulatory protein, LysR family  41.03 
 
 		 304 aa  202  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2550  transcriptional regulator, LysR family  40.68 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.673699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4251  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 312 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1002  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0275  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1155  LysR substrate binding domain-containing protein  38.75 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2019  LysR family transcriptional regulator  41.36 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0873  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493245  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0995  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 349 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291336  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2899  transcriptional regulator, LysR family  36.58 
 
 		 301 aa  196  3e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0977536  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5950  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 321 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2431  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 312 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2930  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2809  transcriptional regulator, LysR family  39.32 
 
 		 300 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3506  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 319 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0952  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  36.99 
 
 		 305 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0139  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  36.64 
 
 		 307 aa  185  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0799  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  36.43 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2944  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>