More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0139 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0139  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  621  1e-177  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2431  LysR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 312 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  54.64 
 
 		 301 aa  345  6e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3183  LysR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 299 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224527  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2534  LysR family transcriptional regulator  51.38 
 
 		 299 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.487932  normal  0.277262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2019  LysR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 296 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  41.95 
 
 		 305 aa  276  4e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3053  LysR family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 311 aa  268  8.999999999999999e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23700  LysR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 303 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2909  transcriptional regulator, LysR family  43.05 
 
 		 320 aa  265  7e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2930  LysR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 301 aa  256  4e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  42.12 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2899  transcriptional regulator, LysR family  40.75 
 
 		 301 aa  248  8e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0977536  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1596  transcriptional regulator, LysR family  41.61 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4251  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3506  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2734  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 303 aa  231  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5950  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 321 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  38.7 
 
 		 300 aa  228  8e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0275  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1002  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1155  LysR substrate binding domain-containing protein  38.44 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0873  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493245  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0995  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 349 aa  228  1e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291336  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2550  transcriptional regulator, LysR family  37.58 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.673699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2809  transcriptional regulator, LysR family  38.26 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0952  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3612  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 307 aa  222  7e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.155028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35920  Regulatory protein, LysR family  39.13 
 
 		 304 aa  222  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3664  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 317 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0799  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 320 aa  221  9e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1221  LysR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678817  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3595  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 317 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0546  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 304 aa  218  7e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.921789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  36.86 
 
 		 307 aa  210  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2449  transcriptional regulator, LysR family  38.97 
 
 		 300 aa  209  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00856544  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  34.77 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2283  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 306 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.95602  normal  0.350255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  37.33 
 
 		 308 aa  205  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 303 aa  205  6e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1953  LysR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 304 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1388  LysR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 362 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0522975  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 301 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  35.49 
 
 		 302 aa  202  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 301 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 289 aa  202  8e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2122  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 293 aa  202  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4493  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.878724 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0660  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3197  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 298 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2367  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1056  transcriptional regulator, LysR family  37.54 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0199163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 292 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  35.21 
 
 		 289 aa  199  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 327 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 292 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0909  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 		 308 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.984815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  35.79 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2494  transcriptional regulator, LysR family  35.15 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.395428  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0329  transcriptional regulator, LysR family  36.11 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1039  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1836  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.471013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43240  LysR family transcriptional regulator protein  36.55 
 
 		 302 aa  195  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5139  LysR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 300 aa  195  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.528058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 306 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  34.15 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1187  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>