More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3664 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3664  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 317 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3595  transcriptional regulator, LysR family  97.48 
 
 		 317 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3506  LysR family transcriptional regulator  85.13 
 
 		 319 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23700  LysR family transcriptional regulator  56.11 
 
 		 303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  56.48 
 
 		 305 aa  326  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2909  transcriptional regulator, LysR family  55.12 
 
 		 320 aa  317  1e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2734  LysR family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 303 aa  308  6.999999999999999e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2550  transcriptional regulator, LysR family  54.05 
 
 		 300 aa  305  7e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.673699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2809  transcriptional regulator, LysR family  53.72 
 
 		 300 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1596  transcriptional regulator, LysR family  53.44 
 
 		 305 aa  292  5e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4251  LysR family transcriptional regulator  51.34 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  51.86 
 
 		 301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1155  LysR substrate binding domain-containing protein  50 
 
 		 349 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0995  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 349 aa  271  9e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1002  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0873  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493245  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0275  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35920  Regulatory protein, LysR family  52.03 
 
 		 304 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0952  LysR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0799  LysR family transcriptional regulator  49.03 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2431  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2534  LysR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.487932  normal  0.277262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3183  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 299 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224527  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3053  LysR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2019  LysR family transcriptional regulator  50.34 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5139  LysR family transcriptional regulator  50.74 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.528058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 301 aa  242  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3612  transcriptional regulator, LysR family  46.08 
 
 		 307 aa  235  7e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.155028 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2899  transcriptional regulator, LysR family  45.05 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0977536  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0139  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5950  LysR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 321 aa  232  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2930  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 		 301 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  47.28 
 
 		 300 aa  228  7e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0719  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 303 aa  216  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0546  LysR family transcriptional regulator  46.42 
 
 		 304 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.921789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0776  LysR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 298 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4660  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 298 aa  208  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4655  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4522  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.275616  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  40.92 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0329  transcriptional regulator, LysR family  38.14 
 
 		 298 aa  204  2e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0321  transcriptional regulator, LysR family  38.78 
 
 		 298 aa  201  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 304 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0209  transcriptional regulator, LysR family protein  41.46 
 
 		 293 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 320 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3598  LysR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2455  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 293 aa  199  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2218  LysR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 298 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.42945 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  41.58 
 
 		 299 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 302 aa  196  6e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2389  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 293 aa  195  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0212  LysR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00206756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3400  transcriptional regulator, LysR family  36.91 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0212  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00201  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.91 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0488817  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3613  transcriptional regulator, LysR family  39.53 
 
 		 298 aa  193  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.901661  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00206  hypothetical protein  36.91 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3457  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.451664  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  40 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1041  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 306 aa  192  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0221  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 304 aa  191  9e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0884179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0203  transcriptional regulator, LysR family  36.58 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  36.04 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0219  transcriptional regulator, LysR family  36.91 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0947098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5648  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3431  putative transcriptional regulator  38.49 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0549  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 322 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0583  transcriptional regulator, LysR family  44.52 
 
 		 319 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4862  LysR family transcriptional regulator  42.3 
 
 		 313 aa  189  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0300  LysR substrate binding domain protein  35.67 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3430  transcriptional regulator, LysR family  41.21 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  42.91 
 
 		 342 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40440  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  40.6 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0294  LysR substrate binding domain-containing protein  35.67 
 
 		 304 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02796  putative transcriptional regulator, LysR family protein  38.62 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0796  LysR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 297 aa  187  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.71393  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3771  transcriptional regulator, LysR family  38.06 
 
 		 298 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  39.19 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0420  transcriptional regulator  42.16 
 
 		 343 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0279  LysR substrate binding domain-containing protein  35.33 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2155  LysR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2948  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00477903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  45.17 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  39.54 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0286  LysR substrate binding domain protein  36 
 
 		 304 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 293 aa  186  6e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1181  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 299 aa  186  7e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0742  LysR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 300 aa  185  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1529  transcriptional regulator, LysR family  39.45 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1696  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2913  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 295 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1818  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1372  LysR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0864691 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0912  LysR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.990881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>