More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2899 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2899  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 
301 aa  611  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0977536  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3053  LysR family transcriptional regulator  72.82 
 
 
311 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  70.57 
 
 
300 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2930  LysR family transcriptional regulator  67.45 
 
 
301 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  66.78 
 
 
301 aa  425  1e-118  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0546  LysR family transcriptional regulator  72.48 
 
 
304 aa  423  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.921789  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3612  transcriptional regulator, LysR family  53.87 
 
 
307 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.155028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  51.49 
 
 
310 aa  286  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  50.86 
 
 
305 aa  280  3e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2431  LysR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
312 aa  276  3e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23700  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
303 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0115342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2909  transcriptional regulator, LysR family  48.62 
 
 
320 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 
301 aa  264  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4251  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 
312 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2550  transcriptional regulator, LysR family  47.28 
 
 
300 aa  257  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.673699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2809  transcriptional regulator, LysR family  47.62 
 
 
300 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3183  LysR family transcriptional regulator  45.08 
 
 
299 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224527  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2734  LysR family transcriptional regulator  46.37 
 
 
303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2019  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 
296 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213038  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1596  transcriptional regulator, LysR family  50.34 
 
 
305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2534  LysR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
299 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.487932  normal  0.277262 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0139  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
301 aa  248  8e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0154099 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1155  LysR substrate binding domain-containing protein  44.26 
 
 
349 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0995  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
349 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1002  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
320 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0275  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
320 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0873  LysR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
320 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493245  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3506  LysR family transcriptional regulator  45.82 
 
 
319 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0776  LysR family transcriptional regulator  41.47 
 
 
298 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0952  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
317 aa  236  4e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0799  LysR family transcriptional regulator  43.92 
 
 
320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4660  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 
298 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3595  transcriptional regulator, LysR family  45.67 
 
 
317 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4655  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 
313 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4522  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
298 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.275616  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3664  transcriptional regulator, LysR family  45.05 
 
 
317 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0719  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0329  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 
298 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5139  LysR family transcriptional regulator  45.96 
 
 
300 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.528058  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0321  transcriptional regulator, LysR family  40.49 
 
 
298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2248  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
320 aa  215  5.9999999999999996e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.462301  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 
302 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35920  Regulatory protein, LysR family  44.56 
 
 
304 aa  211  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5950  LysR family transcriptional regulator  43.25 
 
 
321 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1221  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
309 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678817  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
309 aa  209  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
306 aa  208  9e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3430  transcriptional regulator, LysR family  42.21 
 
 
330 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
305 aa  208  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 
304 aa  207  1e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  40.41 
 
 
305 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1181  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
299 aa  205  6e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
300 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
300 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
300 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
300 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
300 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
327 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  40.21 
 
 
313 aa  205  9e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
327 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  40.75 
 
 
327 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  36.64 
 
 
307 aa  204  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01682  transcription regulator protein  39.25 
 
 
309 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3613  transcriptional regulator, LysR family  38.75 
 
 
298 aa  203  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.901661  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3400  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 
304 aa  202  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3771  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 
298 aa  202  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
301 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0212  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
304 aa  202  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
301 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 
301 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00201  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.24 
 
 
304 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0488817  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00206  hypothetical protein  37.24 
 
 
304 aa  202  7e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3457  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
304 aa  202  7e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.451664  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0221  LysR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0884179  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0219  transcriptional regulator, LysR family  37.24 
 
 
304 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0947098  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 
302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0203  transcriptional regulator, LysR family  36.9 
 
 
304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
301 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
305 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  36.3 
 
 
302 aa  200  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0212  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00206756  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  38.54 
 
 
335 aa  199  5e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
314 aa  197  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2948  LysR family transcriptional regulator  35.02 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00477903  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1090  transcriptional regulator, LysR family  38.98 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  36.71 
 
 
298 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3431  putative transcriptional regulator  36.58 
 
 
327 aa  196  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 
300 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1529  transcriptional regulator, LysR family  34.68 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205298  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0905  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
295 aa  196  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0286  LysR substrate binding domain protein  36.82 
 
 
304 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0300  LysR substrate binding domain protein  36.61 
 
 
304 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0294  LysR substrate binding domain-containing protein  36.61 
 
 
304 aa  195  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0994  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 
298 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40440  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 
295 aa  195  9e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>