More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6559 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6559  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0416892  normal  0.379157 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6075  LysR family transcriptional regulator  99 
 
 		 300 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.22957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5711  LysR family transcriptional regulator  99 
 
 		 300 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4672  LysR family transcriptional regulator  88.67 
 
 		 300 aa  521  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1152  transcription regulator protein  63.85 
 
 		 297 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.311486  normal  0.319269 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1090  transcriptional regulator, LysR family  63.82 
 
 		 298 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0994  transcriptional regulator, LysR family  63.82 
 
 		 298 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4262  LysR family transcriptional regulator  63.73 
 
 		 298 aa  348  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.932976  decreased coverage  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5574  LysR family transcriptional regulator  60.54 
 
 		 300 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0285  LysR family transcriptional regulator  59.93 
 
 		 298 aa  331  8e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3613  transcriptional regulator, LysR family  57 
 
 		 298 aa  331  1e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.901661  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4749  LysR family transcriptional regulator  61.59 
 
 		 314 aa  329  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3771  transcriptional regulator, LysR family  56.66 
 
 		 298 aa  328  5.0000000000000004e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5294  LysR family transcriptional regulator  61.25 
 
 		 314 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.60541 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0241  LysR family transcriptional regulator  59.06 
 
 		 313 aa  326  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0944  LysR family transcriptional regulator  57.82 
 
 		 297 aa  325  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3353  LysR family transcriptional regulator  60.21 
 
 		 315 aa  324  9e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0979996 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40440  LysR family transcriptional regulator  54.92 
 
 		 295 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4862  LysR family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 313 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2155  LysR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5408  LysR family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 314 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0105986 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5454  LysR family transcriptional regulator  59.86 
 
 		 314 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0420  transcriptional regulator  59.12 
 
 		 343 aa  322  5e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0321  transcriptional regulator, LysR family  53.92 
 
 		 298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0329  transcriptional regulator, LysR family  53.58 
 
 		 298 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4660  LysR family transcriptional regulator  55.29 
 
 		 298 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2948  LysR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 298 aa  318  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00477903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4522  LysR family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.275616  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4655  LysR family transcriptional regulator  55.33 
 
 		 313 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0660  LysR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 303 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1529  transcriptional regulator, LysR family  52.53 
 
 		 298 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3431  putative transcriptional regulator  54.24 
 
 		 327 aa  315  7e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3897  transcriptional regulator, LysR family  57.24 
 
 		 300 aa  314  9.999999999999999e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.514135  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5365  putative LysR family transcriptional regulator  57.79 
 
 		 300 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.278218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0579  LysR family substrate binding transcriptional regulator  59.93 
 
 		 303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0278  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  59.93 
 
 		 303 aa  312  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5117  LysR family transcriptional regulator  58.13 
 
 		 300 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0776  LysR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 298 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0067  LysR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 302 aa  309  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0719  LysR family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1181  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 299 aa  307  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4004  LysR family transcriptional regulator  57 
 
 		 295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.242655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2800  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 291 aa  269  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.111359  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02796  putative transcriptional regulator, LysR family protein  44.71 
 
 		 299 aa  257  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0905  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3598  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 293 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00201  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.53 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0488817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0212  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 304 aa  247  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00206756  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3457  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.451664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0203  transcriptional regulator, LysR family  40.86 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00206  hypothetical protein  40.53 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0209  transcriptional regulator, LysR family protein  42.37 
 
 		 293 aa  248  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2389  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 293 aa  248  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3400  transcriptional regulator, LysR family  40.53 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0294  LysR substrate binding domain-containing protein  41.5 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0219  transcriptional regulator, LysR family  40.53 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0947098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0212  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0286  LysR substrate binding domain protein  41.16 
 
 		 304 aa  246  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0221  LysR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0884179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0300  LysR substrate binding domain protein  41.5 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2455  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 293 aa  246  4e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0279  LysR substrate binding domain-containing protein  41.5 
 
 		 304 aa  246  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0281  LysR substrate binding domain protein  41.16 
 
 		 304 aa  245  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0742  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 300 aa  243  1.9999999999999999e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2705  regulatory protein, LysR  40 
 
 		 286 aa  237  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3506  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2899  transcriptional regulator, LysR family  37.16 
 
 		 301 aa  193  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0977536  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3053  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 311 aa  192  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2930  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2734  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  36.15 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2550  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.673699 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3183  LysR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 299 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224527  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2534  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 299 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.487932  normal  0.277262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2431  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3612  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.155028 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23700  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115342 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3595  transcriptional regulator, LysR family  37.88 
 
 		 317 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2809  transcriptional regulator, LysR family  35.17 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  35.49 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2019  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 296 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6129  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 289 aa  172  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 314 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 289 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3664  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0747  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  33.8 
 
 		 290 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.796071  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5274  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3430  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 330 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2909  transcriptional regulator, LysR family  36.95 
 
 		 320 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.441228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0546  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.921789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34690  LysR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 297 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0262778  normal  0.106193 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1596  transcriptional regulator, LysR family  36.93 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2944  putative transcriptional regulator  34.24 
 
 		 297 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.625117  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0139  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154099 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  34.02 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>