More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2408 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_2408  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  588  1e-167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0423159  normal  0.525947 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1221  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 309 aa  231  2e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678817  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 302 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4232  carbonate dehydratase  37.81 
 
 		 289 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000232431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3183  LysR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224527  normal  0.322731 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0165  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.705858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0329  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.91689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2431  LysR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.517573 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3440  transcriptional regulator, LysR family protein  37.81 
 
 		 289 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2534  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 299 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.487932  normal  0.277262 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2527  LysR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.618648 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23700  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0115342 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1529  transcriptional regulator, LysR family  37.5 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.205298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2175  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1939  transcriptional regulator, LysR family  35.34 
 
 		 292 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.775483 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00201  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.26 
 
 		 304 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0488817  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0203  transcriptional regulator, LysR family  38.59 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00206  hypothetical protein  38.26 
 
 		 304 aa  193  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 289 aa  194  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3457  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 304 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.451664  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3400  transcriptional regulator, LysR family  37.71 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2420  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2409  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 292 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.687274  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0212  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0372  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 292 aa  192  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0212  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 304 aa  192  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00206756  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0221  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 304 aa  193  4e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0884179  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0219  transcriptional regulator, LysR family  38.26 
 
 		 304 aa  192  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0947098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16720  transcriptional regulator  37.46 
 
 		 300 aa  192  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4060  transcriptional regulator, LysR family protein  36.4 
 
 		 288 aa  192  8e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.833958  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2053  LysR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0554  LysR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0255315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0294  LysR substrate binding domain-containing protein  37.25 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0139  LysR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0154099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2719  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 310 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.170662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1836  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.471013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0300  LysR substrate binding domain protein  37.25 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1785  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0286  LysR substrate binding domain protein  37.25 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.492247 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0742  LysR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.787719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0321  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0279  LysR substrate binding domain-containing protein  36.95 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3029  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 304 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686925 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2948  LysR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 298 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00477903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2192  LysR family transcriptional regulator  34.28 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0995  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0291336  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2019  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 296 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0275  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0423323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1002  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1155  LysR substrate binding domain-containing protein  39.31 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.947085  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1061  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0873  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.493245  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0281  LysR substrate binding domain protein  37.25 
 
 		 304 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0816  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 289 aa  187  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1124  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3529  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  34.28 
 
 		 298 aa  186  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1509  putative transcriptional regulator  35.56 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20810  transcriptional regulator, LysR family  38.41 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3910  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.268348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1940  LysR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2122  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2550  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.673699 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1436  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1181  LysR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0952  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 317 aa  183  3e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3053  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 311 aa  183  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4060  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4660  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.727682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17380  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 302 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1366  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.8 
 
 		 298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1672  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.255647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 303 aa  182  7e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1169  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 298 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.695965 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0776  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 298 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.580459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0747  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  33.92 
 
 		 290 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.796071  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0905  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1539  LysR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014478  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1557  transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2899  transcriptional regulator, LysR family  34.83 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0977536  normal  0.071829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4522  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.275616  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3768  LysR, substrate-binding  33.22 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3066  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 313 aa  180  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4162  LysR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265512  normal  0.711373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1615  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86393  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2792  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.32 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2930  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  33.8 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0994  transcriptional regulator, LysR family  38.72 
 
 		 298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.294309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4655  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1545  transcriptional regulator, LysR family  36.46 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.813324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 310 aa  178  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2831  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2813  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40440  LysR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 295 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2956  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 312 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3612  transcriptional regulator, LysR family  37.15 
 
 		 307 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.155028 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1033  LysR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0005  LysR, substrate-binding  34.28 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000616557 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>