More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4851 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4851  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 298 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.204914  normal  0.243062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2700  LysR family transcriptional regulator  55.89 
 
 		 303 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469247  normal  0.332498 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2249  transcriptional regulator, LysR family  56.23 
 
 		 309 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2019  LysR family transcriptional regulator  55.22 
 
 		 309 aa  358  7e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2676  transcriptional regulator, LysR family  59.32 
 
 		 300 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5810  LysR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 300 aa  328  9e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.438926 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2398  LysR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 300 aa  328  9e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5874  LysR family transcriptional regulator  53.22 
 
 		 345 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6111  LysR family transcriptional regulator  53.56 
 
 		 310 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.450926  normal  0.171715 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2527  LysR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 300 aa  324  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6414  LysR family transcriptional regulator  52.72 
 
 		 310 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4353  transcriptional regulator, LysR family  51.19 
 
 		 304 aa  322  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5908  LysR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 306 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5543  LysR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 340 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21475  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2503  LysR family transcriptional regulator  53.54 
 
 		 300 aa  315  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2478  LysR family transcriptional regulator  53.2 
 
 		 300 aa  314  9e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0310179  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1867  LysR family transcriptional regulator  53.2 
 
 		 300 aa  314  9e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3403  LysR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 304 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.641186 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6426  transcriptional regulator, LysR family  50.17 
 
 		 304 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.742586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2994  LysR family transcriptional regulator  47.99 
 
 		 331 aa  290  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0939  transcriptional regulator, LysR family  37.11 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.133683  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1360  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 303 aa  212  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813315 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3576  carbonate dehydratase  37.46 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  33.68 
 
 		 304 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1024  LysR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 304 aa  210  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5139  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357677  normal  0.250764 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2660  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 300 aa  205  8e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0674  transcriptional regulator, LysR family  34.13 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5951  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6256  LysR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  34.93 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 303 aa  198  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  38.81 
 
 		 299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09910  putative transcriptional regulator  36.52 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280275  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 295 aa  193  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2017  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.304165  normal  0.0736532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3226  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1295  LysR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0760  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.76 
 
 		 299 aa  191  9e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4684  LysR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 323 aa  191  9e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02618  transcription regulator protein  34.83 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5481  transcriptional regulator LysR family  32.88 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0288918  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2368  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5596  transcriptional regulator, LysR family  33.11 
 
 		 308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5274  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 321 aa  189  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0632  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.335341  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0520  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 299 aa  189  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.749141  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1235  LysR family transcriptional regulator  36.53 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0125113  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2286  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 303 aa  188  9e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1430  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 299 aa  188  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1235  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0320843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0850  transcriptional regulator, LysR family  34.69 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.840067  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4869  LysR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1564  LysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31780  LysR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 303 aa  186  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2592  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.786682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3755  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 319 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2818  LysR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1461  LysR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.580178  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3431  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 309 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2532  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 303 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4337  LysR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1356  transcriptional regulator, LysR family  34.35 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4337  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4227  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4955  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846935  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1790  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0746  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2868  transcriptional regulator, LysR family protein  32.87 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0376307  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2818  LysR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 299 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.50081  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3209  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 298 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  34.49 
 
 		 311 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0247  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 305 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112344 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1244  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2438  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565253  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3212  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0784  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3831  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 335 aa  180  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.267692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0248  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 305 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000146756 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 299 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0327  LysR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 308 aa  179  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal  0.389567 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2063  transcriptional regulator, LysR family  36.64 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.656887 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5698  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167817 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4606  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.127451  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2618  putative HTH-type transcriptional regulator YafC  32.99 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.811729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>