More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0952 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0952  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  615  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.102057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3551  LysR family transcriptional regulator  93.98 
 
 		 299 aa  585  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3426  LysR family transcriptional regulator  93.65 
 
 		 299 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3354  transcriptional regulator, LysR family  93.98 
 
 		 299 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0333  LysR family transcriptional regulator  53.58 
 
 		 299 aa  309  4e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2722  LysR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 295 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.771142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0567  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0502789  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002880  putative transcriptional regulator LysR family  36.08 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1081  transcriptional regulator AphB  36.08 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03092  transcriptional regulator  35.54 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4517  transcriptional regulator, LysR family  34.03 
 
 		 311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.408069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4649  transcriptional regulator, LysR family  34.03 
 
 		 311 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  0.0278568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 306 aa  168  8e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  33.79 
 
 		 303 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 302 aa  165  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0670  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 303 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3906  LysR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39160  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.255585  normal  0.408672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1001  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3325  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 312 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0401  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0930057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16470  transcriptional regulator, LysR family  33.91 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  32.41 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0999  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 302 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3680  transcriptional regulator, LysR family  33.56 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 303 aa  148  9e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4320  LysR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 307 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  32.29 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3130  LysR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.171352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  32.07 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  30.1 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3921  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 298 aa  145  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0551  LysR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 299 aa  145  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2277  putative transcriptional regulator  31.83 
 
 		 297 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.777908  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3918  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 299 aa  145  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.228486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1973  LysR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 307 aa  145  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0522  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3870  putative transcriptional regulator  30.8 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.405251  normal  0.618692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1967  transcriptional regulator, LysR family  32.18 
 
 		 297 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256766 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2774  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0080  LysR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.622629  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4613  transcriptional regulator, LysR family  32.2 
 
 		 296 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.565718 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 351 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 351 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3335  putative transcriptional regulator  32.44 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.33 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 351 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 351 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 351 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 351 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 351 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3498  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00180927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0498  transcriptional regulator, LysR family protein  33.22 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.883152  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00906  transcription regulator protein  31.51 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.440828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2916  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 351 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2865  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2824  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001040  transcriptional regulator  30.21 
 
 		 318 aa  142  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0611  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48770  putative transcriptional regulator  29.14 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120965  hitchhiker  0.00000153166 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4177  transcriptional regulator  29.47 
 
 		 304 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1729  transcription regulator protein  29.53 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  31.03 
 
 		 301 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3512  transcriptional regulator  33.22 
 
 		 300 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4901  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2006  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.126264  normal  0.0111016 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0773  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3955  LysR family transcriptional regulator  31.83 
 
 		 311 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.116916  normal  0.984212 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3853  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 349 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 349 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2573  LysR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.888641  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2605  LysR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.983354  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0493  LysR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2697  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  29.72 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2753  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 300 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3712  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75932 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 349 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2297  LysR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 304 aa  140  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000212474  hitchhiker  0.000857441 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0823  LysR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26880  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.427626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7382  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 294 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 349 aa  140  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3684  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6327  LysR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4475  LysR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0931  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  31.27 
 
 		 312 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>