More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0773 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0773  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 315 aa  636    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00220265  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2339  LysR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 317 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1518  transcriptional regulator, LysR family  40.32 
 
 		 317 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2542  LysR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 311 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  0.053524 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2006  LysR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01082  transcriptional regulator  41.86 
 
 		 337 aa  228  9e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000539431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06237  transcriptional regulator  41.86 
 
 		 337 aa  228  9e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4261  LysR family transcriptional regulator  42.32 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.902003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2104  LysR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1994  LysR family substrate binding transcriptional regulator  42.24 
 
 		 301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.415294  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2357  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  42.24 
 
 		 301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.189784  normal  0.547268 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1948  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 325 aa  225  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0632109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1541  LysR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1973  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.36 
 
 		 315 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1955  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 310 aa  222  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.043876 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2532  transcriptional regulator, LysR family  41.08 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3143  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 336 aa  221  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937784  normal  0.0533201 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1075  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0356329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1405  transcriptional regulator, LysR family  40.61 
 
 		 329 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223999  normal  0.124738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4416  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2119  LysR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01787  transcription regulator protein  41.91 
 
 		 297 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.933146 
 
 
-
 
NC_003296  RS05302  transcription regulator protein  41.41 
 
 		 329 aa  220  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2027  LysR family transcriptional regulator  39.54 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4312  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2226  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2201  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.253143  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5876  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4153  transcriptional regulator, LysR family  40.86 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2240  LysR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 325 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2373  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 301 aa  219  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4265  transcriptional regulator, LysR family  40.86 
 
 		 315 aa  219  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.562442 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5530  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 324 aa  218  1e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0616  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 330 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1929  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 323 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0518  LysR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 330 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4685  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 301 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4592  LysR family transcriptional regulator  38.59 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0243  LysR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3472  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4053  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 302 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4313  LysR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 302 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2097  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1508  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2964  transcriptional regulator, LysR family  42.62 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0781  LysR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3747  LysR, substrate-binding  37.41 
 
 		 301 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39160  LysR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 311 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.255585  normal  0.408672 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4092  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 305 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.141925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5119  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2074  transcriptional regulator, LysR family  37.12 
 
 		 298 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1481  LysR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 301 aa  202  8e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3986  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0999  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 302 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4320  LysR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2311  transcriptional regulator, LysR family  36.49 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.886713 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3985  LysR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2189  transcriptional regulator, LysR family  41.64 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0615  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 312 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.683803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0225  LysR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.890252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2865  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2916  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2824  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2605  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.983354  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0965  LysR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292002  normal  0.0128926 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4759  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 314 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.983634  normal  0.183649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5304  LysR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707101 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8248  transcriptional regulator, LysR family  38.67 
 
 		 301 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3335  putative transcriptional regulator  38.54 
 
 		 311 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1472  LysR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 301 aa  195  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5249  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 303 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5159  LysR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 303 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.345446  normal  0.286178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2753  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2154  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.224535  normal  0.610808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3137  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00811136  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4263  LysR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.391438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1127  LysR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5499  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2889  LysR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2361  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  34.31 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  37.41 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  37.76 
 
 		 298 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0756  LysR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 305 aa  180  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3576  carbonate dehydratase  32.69 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0958  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.360669  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1052  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1018  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0986  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.27213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1067  transcriptional regulator, LysR family  39.04 
 
 		 303 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.513058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3182  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 303 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795153  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33440  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 312 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0395632  normal  0.113428 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0280  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2001  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0200858  normal  0.0149686 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1029  LysR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874195  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0927  LysR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.503807  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3755  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4145  transcriptional regulator, LysR family  36.25 
 
 		 315 aa  176  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2586  LysR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0277024  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>