More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0931 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_0931  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 300 aa  578  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0991  transcriptional regulator, LysR family  96.67 
 
 		 300 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00933399  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0988  transcriptional regulator, LysR family  96.33 
 
 		 300 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.882538  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3640  LysR family transcriptional regulator  67.24 
 
 		 298 aa  394  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.101202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3290  transcriptional regulator, LysR family  45.33 
 
 		 297 aa  229  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00939534  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2214  LysR family transcriptional regulator  47.75 
 
 		 300 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000844726  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1733  transcriptional regulator, LysR family  46.71 
 
 		 301 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1660  transcriptional regulator, LysR family  46.71 
 
 		 301 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0094894  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0542  transcription regulator protein  39.26 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1967  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 297 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0437  transcriptional regulator, LysR family  39.6 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.704934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 335 aa  183  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0423  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  hitchhiker  0.000106922 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 303 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1650  transcriptional regulator, LysR family  41.96 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 305 aa  178  8e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.89 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  34.64 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  36.77 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 303 aa  175  6e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  36.62 
 
 		 305 aa  176  6e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 299 aa  176  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 306 aa  175  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 298 aa  175  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5365  transcriptional regulator, LysR family  41 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.853701  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2482  transcriptional regulator, LysR family  42.36 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  38.83 
 
 		 293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 298 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 310 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 296 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1448  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0364851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1470  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0988  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 302 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.29091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1344  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00247694  normal  0.0669225 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  38.87 
 
 		 299 aa  170  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 299 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5239  transcriptional regulator, LysR family  40.07 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7382  LysR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 307 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1355  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 294 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 303 aa  168  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  37.72 
 
 		 298 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3212  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04020  Transcriptional regulator, LysR family  36.61 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.010464  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06921  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 289 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  34.01 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1395  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 301 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.465042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0783  LysR, substrate-binding  34.48 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2760  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3182  transcriptional regulator, LysR family  37.07 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.795153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.83 
 
 		 302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  37.02 
 
 		 298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1919  LysR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 307 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3755  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3576  carbonate dehydratase  32.99 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2327  transcription regulator protein  37.81 
 
 		 299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.170216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1993  putative transcriptional regulator  38.7 
 
 		 306 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 306 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2190  transcriptional regulator, LysR family  41.81 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0283977  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1210  LysR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.467633  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2339  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1356  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.21 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 349 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2356  transcriptional regulator, LysR family  35.17 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118407  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 349 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 349 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4209  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 349 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23540  putative transcriptional regulator  38.41 
 
 		 306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483794 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3811  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.349623  normal  0.409757 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4334  LysR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.199355 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1959  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.070179  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 349 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 349 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2542  LysR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  0.053524 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 349 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1787  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 301 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0831  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 296 aa  162  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  32.07 
 
 		 298 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  36.15 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0873  LysR family transcriptional regulator  38.29 
 
 		 295 aa  162  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155303  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>