More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3640 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3640  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.101202 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0931  LysR family transcriptional regulator  67.24 
 
 		 300 aa  394  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0988  transcriptional regulator, LysR family  66.89 
 
 		 300 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.882538  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0991  transcriptional regulator, LysR family  66.55 
 
 		 300 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00933399  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3290  transcriptional regulator, LysR family  45.7 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00939534  normal  0.176899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0542  transcription regulator protein  38.03 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1733  transcriptional regulator, LysR family  41.53 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368943  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0437  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.704934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0423  transcriptional regulator, LysR family  40.4 
 
 		 305 aa  189  7e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.586718  hitchhiker  0.000106922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2214  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 300 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000844726  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1660  transcriptional regulator, LysR family  41.2 
 
 		 301 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0094894  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 305 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  36.68 
 
 		 307 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 		 335 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.79 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 302 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3212  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  35.91 
 
 		 305 aa  172  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2679  LysR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 303 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0566483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2698  LysR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 306 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1650  transcriptional regulator, LysR family  38.57 
 
 		 311 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1344  transcriptional regulator, LysR family  38.61 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00247694  normal  0.0669225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3170  LysR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2545  LysR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 303 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4520  LysR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 309 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.152397 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7382  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  36 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2223  LysR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.499839  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4276  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 307 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2339  LysR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0498  transcriptional regulator, LysR family protein  33.66 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.883152  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1688  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0669222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0806  LysR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0523  LysR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2679  transcriptional regulator, LysR family  34.56 
 
 		 310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3576  carbonate dehydratase  34.38 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1518  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3788  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0481  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3844  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3970  LysR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0121  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92229  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2250  LysR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 302 aa  163  3e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3510  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1997  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 298 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2542  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  0.053524 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0521  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0131  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1993  putative transcriptional regulator  35.71 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2924  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.842726  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0129  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.868323  normal  0.261598 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 298 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0522  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 317 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5774  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 305 aa  162  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3407  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 311 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6421  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 305 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5534  LysR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2482  transcriptional regulator, LysR family  36.45 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0131  LysR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  32.53 
 
 		 298 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5917  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 302 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5552  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 305 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3680  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4592  LysR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 298 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 302 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0873  LysR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.155303  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3755  LysR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 319 aa  159  4e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2356  transcriptional regulator, LysR family  34.25 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118407  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0401  LysR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0930057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 296 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4209  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 302 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 349 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 349 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1541  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 309 aa  159  7e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  35.2 
 
 		 306 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 349 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 295 aa  158  8e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2761  transcriptional regulator, LysR family  36.43 
 
 		 302 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.434624 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 349 aa  158  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 313 aa  158  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2358  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 302 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.10773 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23540  putative transcriptional regulator  35.03 
 
 		 306 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 349 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0145  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 349 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2373  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6475  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 299 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.820215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4938  LysR family transcriptional regulator  37.92 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>