More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5708 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5708  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0328059 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5151  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4531  LysR family transcriptional regulator  99.02 
 
 		 307 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4977  LysR family transcriptional regulator  95.74 
 
 		 307 aa  591  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3120  LysR family transcriptional regulator  95.41 
 
 		 330 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.540342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3172  LysR family transcriptional regulator  93.16 
 
 		 307 aa  585  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5316  LysR family transcriptional regulator  91.8 
 
 		 335 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230906  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0012  LysR family transcriptional regulator  85.76 
 
 		 305 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1160  LysR family transcriptional regulator  85.76 
 
 		 305 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1519  LysR family transcriptional regulator  85.76 
 
 		 305 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0015  LysR family transcriptional regulator  85.76 
 
 		 305 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0015  LysR family transcriptional regulator  85.76 
 
 		 305 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1441  LysR family transcriptional regulator  85.76 
 
 		 305 aa  526  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428684  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0014  LysR family transcriptional regulator  85.76 
 
 		 335 aa  523  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6570  LysR family transcriptional regulator  76.9 
 
 		 305 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.720722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6097  transcriptional regulator, LysR family  75.33 
 
 		 318 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.867989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1487  LysR family transcriptional regulator  74.18 
 
 		 313 aa  455  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396455  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6018  LysR family transcriptional regulator  73.83 
 
 		 300 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2361  LysR family transcriptional regulator  63.25 
 
 		 326 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.990733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2088  LysR family transcriptional regulator  64.95 
 
 		 342 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.320314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1887  LysR family transcriptional regulator  56.42 
 
 		 307 aa  350  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1834  LysR family transcriptional regulator  56.42 
 
 		 307 aa  350  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  56.42 
 
 		 307 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1389  LysR family transcriptional regulator  56.42 
 
 		 307 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.393156  normal  0.955383 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01757  hypothetical protein  56.42 
 
 		 307 aa  350  2e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2025  LysR family transcriptional regulator  56.42 
 
 		 307 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000110123  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2525  transcriptional regulator, LysR family  56.42 
 
 		 307 aa  350  2e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09480  transcriptional regulator, LysR family  53.69 
 
 		 304 aa  347  1e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.25707  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1844  transcriptional regulator, LysR family  56.76 
 
 		 307 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2358  LysR family transcriptional regulator  52.01 
 
 		 321 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.985354  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2197  LysR family transcriptional regulator  56.08 
 
 		 303 aa  331  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1615  LysR family transcriptional regulator  56.01 
 
 		 313 aa  326  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.502684  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1511  LysR family substrate binding transcriptional regulator  56.01 
 
 		 313 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1757  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  56.01 
 
 		 313 aa  326  4.0000000000000003e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000061659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  55.41 
 
 		 304 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0208652  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2663  transcriptional regulator, LysR family  54.79 
 
 		 301 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0779415  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5033  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  51.34 
 
 		 319 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3353  transcriptional activator TtdR  48.11 
 
 		 310 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.577142  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02930  predicted DNA-binding transcriptional regulator  47.77 
 
 		 310 aa  292  4e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0022529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0640  transcriptional regulator, LysR family  47.77 
 
 		 310 aa  292  4e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0380371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3523  transcriptional activator TtdR  47.77 
 
 		 310 aa  292  4e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00521564  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02880  hypothetical protein  47.77 
 
 		 310 aa  292  4e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00207281  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0639  transcriptional activator TtdR  47.77 
 
 		 310 aa  292  4e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000511538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4372  transcriptional activator TtdR  47.77 
 
 		 310 aa  292  5e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0240245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5765  LysR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5815  transcriptional regulator, LysR family  46.71 
 
 		 318 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.416763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0374  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.26292  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0426  LysR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.144523  hitchhiker  0.000318501 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0367  transcriptional regulator, LysR family  45.55 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0365  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.916337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1298  transcriptional regulator, LysR family  41.84 
 
 		 301 aa  259  3e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1136  LysR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  43.36 
 
 		 308 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  44.14 
 
 		 300 aa  245  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 304 aa  242  7e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1039  transcriptional regulator, LysR family  43.79 
 
 		 304 aa  241  9e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5036  transcriptional regulator, LysR family  42.19 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.617167 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1621  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466233  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3358  LysR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1015  LysR family transcriptional regulator  42.46 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2112  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 307 aa  225  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal  0.0118464 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3031  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 315 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3385  LysR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 315 aa  225  8e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2499  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3708  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409936  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4655  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 306 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6389  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02329  transcription regulator protein  40.62 
 
 		 306 aa  218  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0102283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3813  LysR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 310 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5439  LysR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 306 aa  218  7e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5391  LysR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0722  LysR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5656  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5025  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 302 aa  216  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3592  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.503754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4284  LysR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 309 aa  212  7.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1493  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1028  transcriptional regulator, LysR family  41.32 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3236  transcriptional regulator, LysR family  38.49 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3165  transcriptional regulator, LysR family  37.79 
 
 		 304 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0266  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 289 aa  209  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3187  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 307 aa  209  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 		 298 aa  208  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1871  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 310 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.76534  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3175  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 309 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303245 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  41.03 
 
 		 298 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1717  LysR family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 304 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5076  LysR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3068  LysR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 338 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.254873  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1689  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 313 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>