More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5025 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_5025  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
302 aa  615  1e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5439  LysR family transcriptional regulator  96.69 
 
 
306 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3708  LysR family transcriptional regulator  96.01 
 
 
306 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409936  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3592  LysR family transcriptional regulator  95.7 
 
 
306 aa  567  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.503754  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4655  LysR family transcriptional regulator  96.01 
 
 
306 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3813  LysR family transcriptional regulator  95.35 
 
 
310 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5656  LysR family transcriptional regulator  84.67 
 
 
306 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5036  transcriptional regulator, LysR family  73.75 
 
 
303 aa  461  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.617167 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1230  LysR family transcriptional regulator  80 
 
 
308 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1621  LysR family transcriptional regulator  73.84 
 
 
303 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466233  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0722  LysR family transcriptional regulator  72.05 
 
 
311 aa  434  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378943  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3175  LysR family transcriptional regulator  71.72 
 
 
309 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303245 
 
 
-
 
NC_003296  RS02329  transcription regulator protein  68.47 
 
 
306 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0102283 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3187  LysR family transcriptional regulator  67.57 
 
 
307 aa  421  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1015  LysR family transcriptional regulator  65.55 
 
 
311 aa  407  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0622202 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1028  transcriptional regulator, LysR family  68.35 
 
 
309 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  62.46 
 
 
304 aa  392  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  63.39 
 
 
313 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1039  transcriptional regulator, LysR family  62.46 
 
 
304 aa  390  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2112  LysR family transcriptional regulator  61.15 
 
 
307 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal  0.0118464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  58.82 
 
 
308 aa  348  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  57.68 
 
 
307 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  53.12 
 
 
305 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  48.81 
 
 
300 aa  310  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  51.19 
 
 
297 aa  310  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  52.38 
 
 
308 aa  305  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1136  LysR family transcriptional regulator  51.9 
 
 
306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2499  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 
320 aa  298  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374965  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6389  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 
318 aa  296  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5391  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 
347 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3358  LysR family transcriptional regulator  51.21 
 
 
314 aa  290  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3236  transcriptional regulator, LysR family  51.03 
 
 
311 aa  286  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2774  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 
308 aa  281  7.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3165  transcriptional regulator, LysR family  48.29 
 
 
304 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3385  LysR family transcriptional regulator  47.26 
 
 
315 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3031  LysR family transcriptional regulator  47.26 
 
 
315 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230321  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0846  LysR family transcriptional regulator  50.89 
 
 
237 aa  266  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4284  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 
308 aa  266  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2361  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.990733  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4815  LysR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
307 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2024  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 
301 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6570  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 
305 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.720722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09480  transcriptional regulator, LysR family  41.55 
 
 
304 aa  238  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.25707  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6097  transcriptional regulator, LysR family  41.98 
 
 
318 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.867989  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1487  LysR family transcriptional regulator  41.78 
 
 
313 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396455  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2088  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 
342 aa  235  7e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.320314  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2197  LysR family transcriptional regulator  42.36 
 
 
303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5820  transcriptional regulator, LysR family  39.59 
 
 
301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777062  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
302 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  42.9 
 
 
304 aa  228  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  42.01 
 
 
304 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0208652  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2663  transcriptional regulator, LysR family  40.97 
 
 
301 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0779415  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5151  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
307 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5708  LysR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
307 aa  225  6e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0328059 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0014  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 
335 aa  225  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4531  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 
307 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.884215 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02930  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.31 
 
 
310 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0022529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0640  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 
310 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0380371  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02880  hypothetical protein  39.31 
 
 
310 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00207281  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5316  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 
335 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230906  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3523  transcriptional activator TtdR  39.31 
 
 
310 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00521564  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0639  transcriptional activator TtdR  39.31 
 
 
310 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000511538  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4372  transcriptional activator TtdR  39.31 
 
 
310 aa  223  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0240245  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4977  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 
307 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.43876 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3353  transcriptional activator TtdR  39.31 
 
 
310 aa  223  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.577142  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3552  LysR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
428 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.313254 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3120  LysR family transcriptional regulator  41.16 
 
 
330 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.540342 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6018  LysR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
300 aa  222  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0743  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
307 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3172  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
307 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0015  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
305 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1441  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
305 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0012  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
305 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1519  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
305 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0015  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
305 aa  220  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1160  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 
305 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
301 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6191  transcriptional regulator, LysR family  41.08 
 
 
305 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0753  LysR substrate binding domain-containing protein  47.08 
 
 
276 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
300 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
300 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
300 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
300 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
300 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
301 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
327 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
301 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
327 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3639  transcriptional regulator, LysR family  39.46 
 
 
294 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
301 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5076  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 
313 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
303 aa  215  8e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1717  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2358  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 
321 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.985354  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1689  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0365  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.916337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  38.73 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1389  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
307 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.393156  normal  0.955383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>