More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2499 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2499  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 320 aa  654    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6389  LysR family transcriptional regulator  87.3 
 
 		 318 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5391  LysR family transcriptional regulator  75.39 
 
 		 347 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3358  LysR family transcriptional regulator  66.13 
 
 		 314 aa  429  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3552  LysR family transcriptional regulator  76.72 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.313254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  55.86 
 
 		 308 aa  342  4e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  52.84 
 
 		 313 aa  341  8e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  53.63 
 
 		 305 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1015  LysR family transcriptional regulator  51.33 
 
 		 311 aa  328  9e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622202 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 307 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  50.87 
 
 		 297 aa  315  9e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1039  transcriptional regulator, LysR family  48.48 
 
 		 304 aa  307  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  48.77 
 
 		 300 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 304 aa  305  5.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0753  LysR substrate binding domain-containing protein  61.83 
 
 		 276 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02329  transcription regulator protein  47.85 
 
 		 306 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0102283 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5036  transcriptional regulator, LysR family  50.52 
 
 		 303 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.617167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3175  LysR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303245 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0931  LysR family transcriptional regulator  60.58 
 
 		 360 aa  300  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3187  LysR family transcriptional regulator  48.32 
 
 		 307 aa  300  3e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0764  LysR substrate binding domain-containing protein  60.58 
 
 		 274 aa  299  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0722  LysR family transcriptional regulator  49.5 
 
 		 311 aa  298  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2112  LysR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 307 aa  296  3e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal  0.0118464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1028  transcriptional regulator, LysR family  50.85 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  47.26 
 
 		 308 aa  292  6e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1136  LysR family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 306 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3813  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1621  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 303 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466233  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3708  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409936  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4655  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 306 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5025  LysR family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5656  LysR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3592  LysR family transcriptional regulator  47.64 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.503754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5439  LysR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3385  LysR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 315 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3031  LysR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 315 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4284  LysR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3236  transcriptional regulator, LysR family  44.01 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1230  LysR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2774  LysR family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 308 aa  256  5e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3165  transcriptional regulator, LysR family  43.66 
 
 		 304 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0014  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 335 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6018  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 300 aa  239  5e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1487  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 313 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396455  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0015  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1441  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428684  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0012  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1519  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09480  transcriptional regulator, LysR family  39.52 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.25707  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1160  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0015  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4977  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3120  LysR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 330 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.540342 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6097  transcriptional regulator, LysR family  39.24 
 
 		 318 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.867989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5765  LysR family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0846  LysR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 237 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2361  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.990733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3172  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 307 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3068  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 338 aa  227  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.254873  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5316  LysR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 335 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2088  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.320314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6570  LysR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 305 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.720722 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4531  LysR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 307 aa  225  7e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0791  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 314 aa  225  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.45 
 
 		 307 aa  225  9e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01757  hypothetical protein  39.45 
 
 		 307 aa  225  9e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2525  transcriptional regulator, LysR family  39.45 
 
 		 307 aa  225  9e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2025  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 307 aa  225  9e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000110123  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1389  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 307 aa  225  9e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.393156  normal  0.955383 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5708  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0328059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2358  LysR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.985354  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1834  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5151  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1887  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2663  transcriptional regulator, LysR family  38.64 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0779415  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5033  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.73 
 
 		 319 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 303 aa  223  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02930  predicted DNA-binding transcriptional regulator  35.97 
 
 		 310 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0022529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0640  transcriptional regulator, LysR family  35.97 
 
 		 310 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0380371  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0639  transcriptional activator TtdR  35.97 
 
 		 310 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000511538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02880  hypothetical protein  35.97 
 
 		 310 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00207281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3523  transcriptional activator TtdR  35.97 
 
 		 310 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00521564  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3701  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3353  transcriptional activator TtdR  35.97 
 
 		 310 aa  222  6e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.577142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4815  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 307 aa  221  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4372  transcriptional activator TtdR  35.97 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0240245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.84 
 
 		 304 aa  219  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0208652  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 327 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5820  transcriptional regulator, LysR family  36.82 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777062  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 304 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2197  LysR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 301 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 327 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 301 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>