More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3701 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3701  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  605  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5970  LysR family transcriptional regulator  55.45 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.167101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4815  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 307 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1608  LysR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 317 aa  276  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000207955  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2024  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 301 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5820  transcriptional regulator, LysR family  45.07 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777062  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3397  helix-turn-helix, Fis-type  46.46 
 
 		 294 aa  252  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00341475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5304  LysR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3485  LysR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271812  normal  0.0178536 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2553  LysR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 319 aa  249  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2708  putative transcription regulator protein  47.55 
 
 		 374 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0946983 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3639  transcriptional regulator, LysR family  44.78 
 
 		 294 aa  244  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6191  transcriptional regulator, LysR family  44.71 
 
 		 305 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 307 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5910  transcriptional regulator, LysR family  43.97 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3950  LysR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 319 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.181955 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0968  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 302 aa  231  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3570  LysR family transcriptional regulator  44.77 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  37.86 
 
 		 308 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2499  LysR family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 297 aa  221  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_003296  RS02329  transcription regulator protein  38.18 
 
 		 306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0102283 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3187  LysR family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 307 aa  219  5e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  39.66 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2112  LysR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal  0.0118464 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1015  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 311 aa  215  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 313 aa  215  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5391  LysR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 347 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0722  LysR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 311 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4284  LysR family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3358  LysR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 314 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5036  transcriptional regulator, LysR family  38.36 
 
 		 303 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.617167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1136  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 306 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1028  transcriptional regulator, LysR family  38.91 
 
 		 309 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6389  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 318 aa  208  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2774  LysR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1621  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466233  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3236  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3175  LysR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303245 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5025  LysR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3592  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 306 aa  198  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.503754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5439  LysR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3708  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409936  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4655  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3813  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1039  transcriptional regulator, LysR family  35.44 
 
 		 304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 304 aa  196  3e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3165  transcriptional regulator, LysR family  38.69 
 
 		 304 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3031  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3385  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 301 aa  192  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 301 aa  192  8e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5656  LysR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 306 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  37.59 
 
 		 300 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 303 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1230  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1300  transcriptional regulator, LysR family  35.62 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0246  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 307 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06494  transcriptional regulator  33.9 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0915  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  34.34 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3280  transcription regulator protein  32.76 
 
 		 303 aa  181  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2361  LysR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.990733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1953  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1786  transcriptional regulator, LysR family  36.3 
 
 		 315 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2088  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 342 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.320314  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1780  LysR family substrate binding transcriptional regulator  33.89 
 
 		 306 aa  179  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 300 aa  178  9e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3477  transcriptional regulator, LysR family  31.72 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3150  transcriptional regulator, LysR family  32.62 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000622  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 		 305 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0409  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 325 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.78 
 
 		 304 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2358  LysR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.985354  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3338  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691581  normal  0.62369 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 304 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43240  LysR family transcriptional regulator protein  32.42 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1388  LysR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 362 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0522975  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3446  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>