More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2024 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2024  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
301 aa  610  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5820  transcriptional regulator, LysR family  91.36 
 
 
301 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777062  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4815  LysR family transcriptional regulator  52 
 
 
307 aa  332  3e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3701  LysR family transcriptional regulator  45.39 
 
 
304 aa  265  8e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2553  LysR family transcriptional regulator  44.95 
 
 
319 aa  250  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
297 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5970  LysR family transcriptional regulator  48.2 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.167101 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5304  LysR family transcriptional regulator  43.97 
 
 
323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3485  LysR family transcriptional regulator  43.32 
 
 
308 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271812  normal  0.0178536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1136  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
306 aa  240  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
307 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 
308 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3639  transcriptional regulator, LysR family  41.18 
 
 
294 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3397  helix-turn-helix, Fis-type  40.83 
 
 
294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00341475  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 
300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5439  LysR family transcriptional regulator  42.56 
 
 
306 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3592  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
306 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.503754  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3813  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
310 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1608  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
317 aa  228  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000207955  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02329  transcription regulator protein  38.38 
 
 
306 aa  228  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0102283 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
308 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3570  LysR family transcriptional regulator  44.3 
 
 
319 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176673  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5656  LysR family transcriptional regulator  41.64 
 
 
306 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5025  LysR family transcriptional regulator  40.61 
 
 
302 aa  226  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3708  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 
306 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409936  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4655  LysR family transcriptional regulator  41.87 
 
 
306 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3165  transcriptional regulator, LysR family  40.96 
 
 
304 aa  226  3e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3950  LysR family transcriptional regulator  43.65 
 
 
319 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.181955 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5036  transcriptional regulator, LysR family  39.24 
 
 
303 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.617167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 
305 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2708  putative transcription regulator protein  44.6 
 
 
374 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0946983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  38.05 
 
 
304 aa  219  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1039  transcriptional regulator, LysR family  38.05 
 
 
304 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3236  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 
311 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6191  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 
305 aa  215  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1028  transcriptional regulator, LysR family  38.85 
 
 
309 aa  211  1e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0968  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
302 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3175  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
309 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5910  transcriptional regulator, LysR family  40.92 
 
 
306 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0722  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
311 aa  211  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378943  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1621  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
303 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466233  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2499  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 
320 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374965  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1015  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
311 aa  209  4e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0622202 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2774  LysR family transcriptional regulator  38.54 
 
 
308 aa  208  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3187  LysR family transcriptional regulator  34.8 
 
 
307 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3385  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
315 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6389  LysR family transcriptional regulator  35.23 
 
 
318 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3031  LysR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
315 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230321  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4284  LysR family transcriptional regulator  39.27 
 
 
308 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2112  LysR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
307 aa  202  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal  0.0118464 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5391  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
347 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2361  LysR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
326 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.990733  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
327 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
327 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1230  LysR family transcriptional regulator  38.51 
 
 
308 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3068  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 
338 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.254873  normal  0.274067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3358  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
314 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1630  LysR family transcriptional regulator  37.17 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3353  transcriptional activator TtdR  36.57 
 
 
310 aa  197  3e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.577142  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1786  transcriptional regulator, LysR family  36.84 
 
 
315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
301 aa  195  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.181175 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02930  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.19 
 
 
310 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0022529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0640  transcriptional regulator, LysR family  36.19 
 
 
310 aa  195  7e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0380371  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02880  hypothetical protein  36.19 
 
 
310 aa  195  7e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00207281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3523  transcriptional activator TtdR  36.19 
 
 
310 aa  195  7e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00521564  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4372  transcriptional activator TtdR  34.62 
 
 
310 aa  195  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0240245  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0639  transcriptional activator TtdR  36.19 
 
 
310 aa  195  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000511538  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
307 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
327 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
301 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  35.55 
 
 
301 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  35.22 
 
 
300 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2088  LysR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
342 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.320314  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
301 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
301 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
300 aa  192  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
301 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  35.69 
 
 
303 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  34.77 
 
 
304 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0157  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
304 aa  189  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09480  transcriptional regulator, LysR family  34.95 
 
 
304 aa  189  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.25707  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3338  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 
299 aa  188  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691581  normal  0.62369 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43240  LysR family transcriptional regulator protein  31.56 
 
 
302 aa  188  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
300 aa  188  9e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5033  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  35.12 
 
 
319 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1300  transcriptional regulator, LysR family  32.11 
 
 
301 aa  188  9e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 
307 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2525  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 
307 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01757  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  187  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2025  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
307 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000110123  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1389  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
307 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.393156  normal  0.955383 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1887  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
307 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1834  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
307 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1757  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  31.14 
 
 
313 aa  186  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000061659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>