More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0409 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0409  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 325 aa  650    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0666  LysR family transcriptional regulator  88.03 
 
 		 324 aa  555  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550126 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0339  LysR family transcriptional regulator  86.82 
 
 		 312 aa  549  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.541519 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0328  transcriptional regulator, LysR family  86.5 
 
 		 312 aa  548  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4493  LysR family transcriptional regulator  80.71 
 
 		 307 aa  512  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.708471  normal  0.878724 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3697  LysR family transcriptional regulator  77.57 
 
 		 321 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0457  transcriptional regulator, LysR family  75.16 
 
 		 314 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0157  LysR family transcriptional regulator  72.64 
 
 		 304 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4164  LysR family transcriptional regulator  68.67 
 
 		 310 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  65.58 
 
 		 301 aa  421  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  65.47 
 
 		 301 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2082  LysR family transcriptional regulator  65.15 
 
 		 301 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  64.82 
 
 		 301 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  64.94 
 
 		 300 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  65.47 
 
 		 307 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  64.82 
 
 		 301 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  64.82 
 
 		 301 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  64.29 
 
 		 300 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  64.17 
 
 		 327 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1649  LysR family transcriptional regulator  64.17 
 
 		 300 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0254834 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  64.17 
 
 		 327 aa  409  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  64.17 
 
 		 300 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  64.17 
 
 		 327 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  64.17 
 
 		 300 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  64.17 
 
 		 300 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  64.17 
 
 		 300 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  64.17 
 
 		 300 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1388  LysR family transcriptional regulator  65.92 
 
 		 362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0522975  normal  0.825805 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1953  LysR family transcriptional regulator  64.98 
 
 		 304 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1234  transcriptional regulator, LysR family  63.23 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.628194 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1300  transcriptional regulator, LysR family  63.23 
 
 		 309 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0123787  normal  0.196397 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1360  transcription regulator protein  63.87 
 
 		 309 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.508448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3100  LysR family transcriptional regulator  59.28 
 
 		 300 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3150  transcriptional regulator, LysR family  45.98 
 
 		 303 aa  305  9.000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3477  transcriptional regulator, LysR family  45.98 
 
 		 303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.193343  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3280  transcription regulator protein  45.81 
 
 		 303 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1300  transcriptional regulator, LysR family  46.91 
 
 		 301 aa  296  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3446  LysR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 331 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1783  transcriptional regulator, LysR family  47.12 
 
 		 304 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0476809  normal  0.294417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2174  LysR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 303 aa  295  6e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.466728  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2298  LysR family transcriptional regulator  47.88 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2423  LysR family transcriptional regulator  47.88 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2258  LysR family transcriptional regulator  47.88 
 
 		 303 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.206002  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1397  LysR family transcriptional regulator  47.23 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.239438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2459  LysR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 304 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157929  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3286  LysR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 303 aa  293  3e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1619  LysR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 303 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal  0.542444 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43240  LysR family transcriptional regulator protein  46.45 
 
 		 302 aa  291  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1814  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 303 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.841651  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1786  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 303 aa  289  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1900  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 303 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000669534 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1877  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 321 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6202  LysR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 321 aa  288  7e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5177  LysR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 303 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2313  LysR family transcriptional regulator  43.69 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0157  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 305 aa  238  8e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000785598  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0178  LysR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 306 aa  238  9e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0527028  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1780  LysR family substrate binding transcriptional regulator  39.68 
 
 		 306 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3009  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 309 aa  232  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4992  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.91 
 
 		 304 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.170896  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0493  transcriptional regulator, LysR family  40.32 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2875  transcriptional regulator, LysR family  36.48 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2494  transcriptional regulator, LysR family  36.48 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 304 aa  225  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1717  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5076  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2544  LysR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 302 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1689  LysR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 313 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 307 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  39.87 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  38.41 
 
 		 335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1493  LysR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 297 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 296 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0393  LysR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00156411  normal  0.514567 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1015  LysR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622202 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1070  transcriptional regulator, LysR family  40.88 
 
 		 310 aa  217  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.651506  decreased coverage  0.00634214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0449  transcriptional regulator, LysR family  38.39 
 
 		 298 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.908719  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2531  LysR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 301 aa  217  2.9999999999999998e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0983  LysR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 298 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  39.39 
 
 		 300 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1802  LysR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 316 aa  215  7e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0497764  normal  0.412734 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 308 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1743  carbonate dehydratase  39.86 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.933417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2326  LysR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231935  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1777  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6302  LysR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3338  LysR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 299 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691581  normal  0.62369 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2062  transcriptional regulator, LysR family  39.86 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  hitchhiker  0.00696993 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1860  transcriptional regulator, LysR family  41.2 
 
 		 318 aa  212  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00131217  normal  0.14029 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4256  LysR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.968203 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  37.95 
 
 		 305 aa  210  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2361  LysR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 326 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.990733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1039  transcriptional regulator, LysR family  38.44 
 
 		 304 aa  208  9e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 304 aa  208  9e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>