More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5653 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 307 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  74.92 
 
 		 308 aa  474  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1015  LysR family transcriptional regulator  63.3 
 
 		 311 aa  386  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622202 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  63.51 
 
 		 313 aa  379  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  57.91 
 
 		 297 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  56.12 
 
 		 300 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 305 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02329  transcription regulator protein  59.17 
 
 		 306 aa  353  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0102283 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  57.1 
 
 		 308 aa  345  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2112  LysR family transcriptional regulator  56.85 
 
 		 307 aa  345  8e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal  0.0118464 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1039  transcriptional regulator, LysR family  56.54 
 
 		 304 aa  338  7e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  56.18 
 
 		 304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3358  LysR family transcriptional regulator  58.68 
 
 		 314 aa  334  9e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3175  LysR family transcriptional regulator  57.95 
 
 		 309 aa  334  1e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0722  LysR family transcriptional regulator  59.23 
 
 		 311 aa  332  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5036  transcriptional regulator, LysR family  56.79 
 
 		 303 aa  331  9e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.617167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1136  LysR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 306 aa  331  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5439  LysR family transcriptional regulator  58.13 
 
 		 306 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5656  LysR family transcriptional regulator  56.95 
 
 		 306 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3592  LysR family transcriptional regulator  57.79 
 
 		 306 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.503754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5025  LysR family transcriptional regulator  57.68 
 
 		 302 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3813  LysR family transcriptional regulator  58.13 
 
 		 310 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3187  LysR family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 307 aa  329  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3708  LysR family transcriptional regulator  57.79 
 
 		 306 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409936  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4655  LysR family transcriptional regulator  57.79 
 
 		 306 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1028  transcriptional regulator, LysR family  58.48 
 
 		 309 aa  328  1.0000000000000001e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1621  LysR family transcriptional regulator  56.79 
 
 		 303 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466233  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2499  LysR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 320 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6389  LysR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 318 aa  318  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3031  LysR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3385  LysR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 315 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3165  transcriptional regulator, LysR family  48.84 
 
 		 304 aa  300  3e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5391  LysR family transcriptional regulator  48.83 
 
 		 347 aa  298  6e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1230  LysR family transcriptional regulator  55.02 
 
 		 308 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4284  LysR family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3236  transcriptional regulator, LysR family  49.15 
 
 		 311 aa  280  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0846  LysR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 237 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2774  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 308 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6570  LysR family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 305 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.720722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09480  transcriptional regulator, LysR family  43.4 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.25707  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0014  LysR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1487  LysR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396455  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5151  LysR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5708  LysR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 307 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0328059 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4531  LysR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 307 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6018  LysR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 300 aa  248  8e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3120  LysR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.540342 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4977  LysR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 307 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2361  LysR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 326 aa  247  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.990733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5316  LysR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6097  transcriptional regulator, LysR family  42.86 
 
 		 318 aa  245  8e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.867989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2358  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.985354  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1441  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428684  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0015  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0015  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0012  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1519  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1160  LysR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 305 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4815  LysR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.44 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01757  hypothetical protein  41.44 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2025  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000110123  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1389  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.393156  normal  0.955383 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2525  transcriptional regulator, LysR family  41.44 
 
 		 307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1834  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3172  LysR family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1887  LysR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2088  LysR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 342 aa  242  7e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.320314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2024  LysR family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1615  LysR family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 313 aa  239  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.502684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1757  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  41.39 
 
 		 313 aa  239  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000061659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1511  LysR family substrate binding transcriptional regulator  41.39 
 
 		 313 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3552  LysR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 428 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.313254 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1588  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0535581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2615  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116489  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2526  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3222  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2090  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 300 aa  235  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000497433  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2473  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 327 aa  234  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1363  LysR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 327 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659256  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3701  LysR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 304 aa  235  9e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5820  transcriptional regulator, LysR family  38.1 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777062  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  43 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2603  LysR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 555 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1996  LysR family transcriptional regulator  39.14 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0901826  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2197  LysR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 303 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1953  LysR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 304 aa  231  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5765  LysR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  44.56 
 
 		 333 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0157  LysR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 304 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02930  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.31 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0022529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0640  transcriptional regulator, LysR family  39.31 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0380371  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1844  transcriptional regulator, LysR family  41.1 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3523  transcriptional activator TtdR  39.31 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00521564  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0639  transcriptional activator TtdR  39.31 
 
 		 310 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000511538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>