More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1621 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1621  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.466233  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5036  transcriptional regulator, LysR family  94.06 
 
 		 303 aa  584  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.617167 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5025  LysR family transcriptional regulator  73.84 
 
 		 302 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5439  LysR family transcriptional regulator  74.17 
 
 		 306 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3813  LysR family transcriptional regulator  73.09 
 
 		 310 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3708  LysR family transcriptional regulator  73.09 
 
 		 306 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.409936  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3592  LysR family transcriptional regulator  73.18 
 
 		 306 aa  441  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.503754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4655  LysR family transcriptional regulator  73.09 
 
 		 306 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5656  LysR family transcriptional regulator  71.62 
 
 		 306 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3175  LysR family transcriptional regulator  71.96 
 
 		 309 aa  431  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000303245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0722  LysR family transcriptional regulator  71.53 
 
 		 311 aa  433  1e-120  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1028  transcriptional regulator, LysR family  71.28 
 
 		 309 aa  424  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0441  LysR family transcriptional regulator  65.99 
 
 		 313 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1015  LysR family transcriptional regulator  67.46 
 
 		 311 aa  414  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0622202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3187  LysR family transcriptional regulator  66.11 
 
 		 307 aa  416  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02329  transcription regulator protein  66.33 
 
 		 306 aa  413  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0102283 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1119  LysR family transcriptional regulator  66.11 
 
 		 304 aa  401  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.503847  normal  0.113213 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1039  transcriptional regulator, LysR family  66.11 
 
 		 304 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1230  LysR family transcriptional regulator  69.67 
 
 		 308 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2112  LysR family transcriptional regulator  62.41 
 
 		 307 aa  371  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618524  normal  0.0118464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31220  Transcriptional regulator, LysR family  56.94 
 
 		 308 aa  339  4e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5653  LysR family transcriptional regulator  56.79 
 
 		 307 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1136  LysR family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 306 aa  318  7.999999999999999e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1229  LysR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.769515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0199  LysR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 308 aa  302  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2499  LysR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 320 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.374965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6389  LysR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 318 aa  295  9e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3358  LysR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 314 aa  294  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6955  LysR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373633  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2733  transcriptional regulator, LysR family  46.92 
 
 		 300 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5391  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 347 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3236  transcriptional regulator, LysR family  50.51 
 
 		 311 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.875851  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2774  LysR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3165  transcriptional regulator, LysR family  49.48 
 
 		 304 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0846  LysR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 237 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3031  LysR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 315 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.230321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3385  LysR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 315 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2361  LysR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 326 aa  255  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.990733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4284  LysR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 308 aa  252  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5708  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 307 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0328059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3172  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.803424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5151  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 307 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4531  LysR family transcriptional regulator  43.05 
 
 		 307 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.884215 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4977  LysR family transcriptional regulator  42.38 
 
 		 307 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.43876 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3120  LysR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.540342 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2088  LysR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 342 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.320314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09480  transcriptional regulator, LysR family  40.88 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.25707  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0014  LysR family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 335 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4815  LysR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 307 aa  233  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6570  LysR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 305 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.720722 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6097  transcriptional regulator, LysR family  41.39 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.867989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5316  LysR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0015  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0012  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1519  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1441  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428684  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1160  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0015  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2024  LysR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0462835 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1487  LysR family transcriptional regulator  41.06 
 
 		 313 aa  225  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.396455  hitchhiker  0.00316946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5820  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.777062  normal  0.764141 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6018  LysR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0753  LysR substrate binding domain-containing protein  48.75 
 
 		 276 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2663  transcriptional regulator, LysR family  40.89 
 
 		 301 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0779415  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2197  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3552  LysR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 428 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.313254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1689  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3701  LysR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1717  LysR family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 313 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2358  LysR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 321 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.985354  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5765  LysR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 318 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.310407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5033  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  39.32 
 
 		 319 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5076  LysR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 313 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2397  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  40.27 
 
 		 304 aa  215  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0208652  normal  0.584211 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5815  transcriptional regulator, LysR family  38.01 
 
 		 318 aa  215  8e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.416763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 303 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1493  LysR family transcriptional regulator  39.86 
 
 		 313 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.994959  normal  0.0324489 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1802  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0497764  normal  0.412734 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5359  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 307 aa  212  7e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.409076  normal  0.253591 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6191  transcriptional regulator, LysR family  40.14 
 
 		 305 aa  211  9e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.395168  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1298  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 301 aa  211  9e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2069  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0764  LysR substrate binding domain-containing protein  47.5 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.908902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1777  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6302  LysR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6027  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 301 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2050  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 301 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.777492  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1227  LysR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 301 aa  208  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.181175 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 304 aa  207  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1952  LysR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 301 aa  207  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.514142 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0931  LysR family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 360 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2326  LysR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231935  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2488  transcriptional regulator, LysR family  36.33 
 
 		 300 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0585408  hitchhiker  0.000785028 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0426  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.144523  hitchhiker  0.000318501 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0367  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 321 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1370  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 300 aa  205  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0374  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 321 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.26292  normal  0.588563 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2025  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 307 aa  205  7e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000110123  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2525  transcriptional regulator, LysR family  35.99 
 
 		 307 aa  205  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1389  LysR family transcriptional regulator  35.99 
 
 		 307 aa  205  7e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.393156  normal  0.955383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>