More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0932 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0932  transcriptional regulator  100 
 
 		 303 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10090  LysR family transcriptional regulator  88.12 
 
 		 303 aa  532  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000636611  normal  0.898763 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2157  transcriptional regulator  65.76 
 
 		 296 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.623501  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1969  LysR family transcriptional regulator  64.56 
 
 		 296 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2779  transcriptional regulator, LysR family  45.7 
 
 		 304 aa  278  9e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.978059  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0156  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  39.79 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 305 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1967  transcriptional regulator, LysR family  35.96 
 
 		 297 aa  159  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256766 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2734  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3610  LysR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2697  transcriptional regulator, LysR family  34.04 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  35.99 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23540  putative transcriptional regulator  36.04 
 
 		 306 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00483794 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  32.75 
 
 		 302 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1993  putative transcriptional regulator  36.75 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2257  LysR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.368371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2366  transcriptional regulator, LysR family  34.67 
 
 		 300 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 298 aa  149  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 300 aa  148  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4265  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.562442 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1211  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159802  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4153  transcriptional regulator, LysR family  36.05 
 
 		 315 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  38.06 
 
 		 315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5398  transcriptional regulator, LysR family  31.38 
 
 		 295 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.187721  normal  0.0384441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5239  transcriptional regulator, LysR family  35.59 
 
 		 310 aa  145  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  31.36 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2482  transcriptional regulator, LysR family  33.77 
 
 		 307 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2560  transcriptional regulator, LysR family  33.22 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2190  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 304 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0283977  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1107  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0401  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 313 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0930057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1390  LysR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3497  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2951  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.28 
 
 		 299 aa  143  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.67844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3621  LysR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2695  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000653  transcriptional regulator LysR family  29.6 
 
 		 293 aa  142  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4684  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.19 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3220  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 		 293 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1970  LysR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 399 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4560  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 302 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.788363  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1915  transcriptional regulator, LysR family  33.67 
 
 		 298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  32.36 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3607  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.22 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.335248 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 294 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4632  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 334 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0243433  normal  0.186568 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0583  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1975  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3098  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.870472  normal  0.210962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1031  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1210  LysR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.467633  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4036  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560639  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3355  transcriptional regulator, LysR family  30.69 
 
 		 303 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.35672  normal  0.0333388 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3215  putative transcriptional regulator protein  30.28 
 
 		 296 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4177  transcriptional regulator  33.67 
 
 		 304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3311  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 294 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2542  LysR family transcriptional regulator  37.59 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535938  normal  0.053524 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5481  transcriptional regulator LysR family  29.35 
 
 		 303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0288918  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1689  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  30 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 299 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05302  transcription regulator protein  36.36 
 
 		 329 aa  139  6e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  31.03 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 298 aa  139  6e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0677  LysR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 299 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0542  transcription regulator protein  33.11 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4864  LysR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3498  LysR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00180927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4688  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 288 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0965  LysR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292002  normal  0.0128926 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2711  LysR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4548  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.5138 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3012  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0225148  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4916  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4494  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 303 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5354  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 334 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2618  putative HTH-type transcriptional regulator YafC  33.66 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.811729  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5166  LysR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 308 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0293  LysR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0309  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.765891  normal  0.171881 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2666  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2116  LysR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 305 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0265238 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2214  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000844726  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3206  LysR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 309 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.160052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48770  putative transcriptional regulator  32.76 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120965  hitchhiker  0.00000153166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>