More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I0276 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007651  BTH_I0276  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 571 aa  1130    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4615  LysR family transcriptional regulator  72.59 
 
 		 307 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0591659 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5689  LysR family transcriptional regulator  72.59 
 
 		 307 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3753  LysR family transcriptional regulator  72.59 
 
 		 307 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2289  transcriptional regulator, LysR family  45.17 
 
 		 353 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1971  LysR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 355 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0397721 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1227  LysR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 312 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0031  LysR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 362 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1403  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 326 aa  188  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000041163  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0124  LysR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3186  LysR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 349 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651713  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3069  LysR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 349 aa  187  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3131  LysR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 349 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154836  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3206  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 326 aa  187  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000350263  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3147  LysR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 349 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.315246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3128  LysR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 349 aa  187  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.677462  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2518  LysR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 349 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2049  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 326 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.0000000535454  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3220  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 326 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000114793  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3167  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 326 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000529291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0864  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 326 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000134216  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1914  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 326 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.00000121317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0153  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 351 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2270  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 351 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.520231  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0138  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 351 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0145  transcriptional regulator  41 
 
 		 351 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0342  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 351 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6482  LysR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 349 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.833038 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2347  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 351 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2811  LysR family transcriptional regulator  41 
 
 		 351 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4420  LysR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 367 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287989 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0305  transcriptional regulator, LysR family  42.53 
 
 		 367 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2140  transcriptional regulator, LysR family  41.54 
 
 		 298 aa  177  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2690  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 295 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2661  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 295 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.583907  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2050  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 295 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2557  LysR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  40.98 
 
 		 293 aa  173  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0706  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 328 aa  170  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0723  LysR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 328 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.562943 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7208  LysR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 313 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0796  LysR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 325 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2428  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 329 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.886071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3919  LysR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 327 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0343  LysR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 327 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0826  LysR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 327 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.325124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2586  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 295 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0388  LysR family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 304 aa  163  6e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2712  LysR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 295 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3684  transcriptional regulator, LysR family  41.06 
 
 		 312 aa  163  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3361  transcriptional regulator, LysR family  40.3 
 
 		 312 aa  160  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.955701  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0065  transcription regulator protein  39.92 
 
 		 312 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  35.52 
 
 		 302 aa  155  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0363  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 298 aa  156  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1328  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.277671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01980  LysR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.445097 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1886  transcriptional regulator, LysR family  39.92 
 
 		 299 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0374  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 299 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.454239 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0361  LysR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 298 aa  153  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0237  putative transcriptional regulator  39.83 
 
 		 355 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3607  LysR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 296 aa  153  8e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0430  transcriptional regulator, LysR family  39.42 
 
 		 293 aa  153  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.1625 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0287  Carbonate dehydratase  36.55 
 
 		 305 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0369  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 295 aa  151  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 307 aa  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3570  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 310 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0783  LysR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 301 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 294 aa  151  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1403  LysR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 305 aa  151  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2533  LysR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 299 aa  150  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2456  LysR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 313 aa  150  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.161377  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3498  LysR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 298 aa  149  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00180927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3413  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 303 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3576  carbonate dehydratase  35.9 
 
 		 309 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5612  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 301 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0432905  normal  0.551599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1970  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 299 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0371  transcriptional regulator, LysR family  34.23 
 
 		 298 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0434666  hitchhiker  0.0000318758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0904  LysR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 302 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0340  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 298 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.366451 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 305 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5829  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 301 aa  148  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10730  transcriptional regulator, LysR family  39.42 
 
 		 311 aa  148  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7201  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 297 aa  148  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 305 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3800  LysR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 298 aa  148  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000185965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 305 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 305 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1859  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  147  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.348315  normal  0.130903 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1272  LysR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 303 aa  147  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.066444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1113  LysR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 318 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.293194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4487  LysR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 307 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 294 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4204  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 322 aa  146  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0430  transcriptional regulator, LysR family  38.31 
 
 		 312 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.716475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2278  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 304 aa  145  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1192  LysR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 316 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000735562  normal  0.361439 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 294 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2081  LysR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 294 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1970  LysR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 399 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 303 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>