More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1467 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  100 
 
 
135 aa  270  4.0000000000000004e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  63.71 
 
 
144 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  61.29 
 
 
139 aa  163  9e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  56.1 
 
 
171 aa  154  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  55.28 
 
 
171 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  52.85 
 
 
171 aa  148  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  58.73 
 
 
132 aa  139  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  50 
 
 
236 aa  127  3e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  48.82 
 
 
150 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  49.61 
 
 
149 aa  123  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  49.22 
 
 
146 aa  120  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  43.51 
 
 
137 aa  120  7e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  51.91 
 
 
153 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  43.31 
 
 
150 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  43.31 
 
 
150 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  42.75 
 
 
137 aa  118  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  51.18 
 
 
154 aa  117  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 
166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  45.11 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  50.39 
 
 
151 aa  114  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  46.92 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  51.59 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  42.64 
 
 
150 aa  110  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  51.61 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  45.52 
 
 
150 aa  105  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  44.09 
 
 
157 aa  105  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  44.19 
 
 
150 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
148 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  48.39 
 
 
140 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  40.77 
 
 
148 aa  104  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  43.08 
 
 
143 aa  103  5e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  43.85 
 
 
229 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  48.72 
 
 
130 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  53.49 
 
 
156 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  44.36 
 
 
231 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 
144 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  41.53 
 
 
137 aa  101  3e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  41.04 
 
 
252 aa  99.4  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  51.18 
 
 
156 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 
228 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 
229 aa  97.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 
179 aa  96.3  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 
164 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
229 aa  94.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 
252 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 
237 aa  91.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 
212 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  42.19 
 
 
186 aa  90.1  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  44.22 
 
 
176 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  49.47 
 
 
224 aa  89  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  36.43 
 
 
240 aa  89.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  43.31 
 
 
232 aa  89  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 
157 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  41.35 
 
 
148 aa  87  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  41.73 
 
 
184 aa  84.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 
151 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 
248 aa  83.6  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  45.3 
 
 
226 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 
267 aa  82  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  41.06 
 
 
273 aa  81.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 
269 aa  80.1  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  39.55 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  38.04 
 
 
303 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
151 aa  78.2  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  35.61 
 
 
233 aa  77.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  41.22 
 
 
242 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 
178 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  41.53 
 
 
286 aa  77  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5598  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  37.41 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  36.76 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
284 aa  74.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 
242 aa  73.9  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 
244 aa  73.9  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  36.5 
 
 
234 aa  73.9  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  45.38 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  40.44 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  43.09 
 
 
229 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  39.13 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  36.44 
 
 
141 aa  72  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1798  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 
164 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2686  hydrolase NUDIX family domain-containing protein  36.36 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310131  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 
246 aa  72  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  43.75 
 
 
244 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 
225 aa  72  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  39.39 
 
 
239 aa  71.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
662 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  39.66 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 
155 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5226  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0916804  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 
265 aa  70.5  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  42.15 
 
 
320 aa  70.5  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  35.21 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>