More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2015 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  100 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1829  NUDIX hydrolase  78.01 
 
 		 150 aa  231  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000906254  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  75.18 
 
 		 150 aa  230  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  73.76 
 
 		 150 aa  226  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  74.5 
 
 		 150 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  66.67 
 
 		 157 aa  180  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  63.24 
 
 		 154 aa  170  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2639  NUDIX hydrolase  62.79 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  64.06 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  65.62 
 
 		 143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  62.02 
 
 		 148 aa  161  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  58.45 
 
 		 153 aa  160  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1935  NUDIX hydrolase  66.13 
 
 		 142 aa  160  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  58.39 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  61.9 
 
 		 149 aa  150  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1187  NUDIX hydrolase  57.81 
 
 		 143 aa  145  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  54.68 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  51.8 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0883  NUDIX hydrolase  57.94 
 
 		 151 aa  133  9e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  48.57 
 
 		 212 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1163  NUDIX hydrolase  54.55 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  49.61 
 
 		 171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  48.84 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1251  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 		 140 aa  127  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00542238  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1123  NUDIX hydrolase  53.85 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.824308  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1530  NUDIX hydrolase  50.38 
 
 		 137 aa  124  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.249617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0842  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 176 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134181 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  51.64 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  49.62 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0519  MutT/nudix family protein  51.59 
 
 		 146 aa  121  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1183  NUDIX hydrolase  53.6 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0529  NUDIX hydrolase  53.54 
 
 		 150 aa  117  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.803448  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  46.77 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2047  NUDIX hydrolase  54.33 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  48.03 
 
 		 236 aa  111  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  42.64 
 
 		 135 aa  110  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  46.83 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1807  mutator MutT-like  41.41 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.829238  normal  0.287731 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  42.98 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  44.27 
 
 		 229 aa  89  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1167  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 164 aa  85.9  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32661  predicted protein  40 
 
 		 237 aa  84.3  6e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.540856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 252 aa  83.6  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2888  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3659  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3713  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.34435 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 252 aa  81.3  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1510  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.23 
 
 		 355 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3998  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0404394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  39.23 
 
 		 229 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  44.35 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  35.66 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1851  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  40 
 
 		 362 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000289338 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  44.7 
 
 		 237 aa  70.5  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  36.23 
 
 		 349 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  41.79 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  43.75 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  37.31 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4178  hydrolase, NUDIX family  29.13 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0036026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  29.13 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0967  hydrolase, NUDIX family  28.35 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00369926  normal  0.920839 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3909  MutT/Nudix family protein  29.13 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0016299  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1798  NUDIX hydrolase  39.16 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 239 aa  67.8  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3901  MutT/Nudix family protein  29.13 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267829  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4253  NUDIX hydrolase  39.82 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103812  normal  0.749922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  41.01 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  28.35 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4267  hydrolase, NUDIX family  27.56 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.555582  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  37.5 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  35.09 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  45.59 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2139  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  38.85 
 
 		 273 aa  63.9  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2074  mutT/nudix family protein  32.2 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000276659  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 		 182 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4063  mutT/nudix family protein  30.25 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000339826  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  47.22 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  31.72 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4380  mutT/nudix family protein  30.25 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000407544  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  38.93 
 
 		 249 aa  62  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  33.59 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.97 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  36.15 
 
 		 662 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  37.6 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>