More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0145 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 252 aa  502  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  91.94 
 
 		 252 aa  458  9.999999999999999e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  79.57 
 
 		 239 aa  341  5.999999999999999e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  69.96 
 
 		 240 aa  328  4e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  50.96 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  48.95 
 
 		 267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  53.14 
 
 		 229 aa  212  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  51.21 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  51.47 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 303 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  38.69 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  42.59 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  49.3 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  45.07 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  44.88 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  48.83 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  44.35 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  49.48 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  43.63 
 
 		 233 aa  169  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  47.34 
 
 		 232 aa  168  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  43.54 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  45.54 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  42.31 
 
 		 228 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  43.69 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  48.79 
 
 		 237 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  44.91 
 
 		 244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  44.39 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  43.93 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  44.76 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  42.04 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  45.79 
 
 		 273 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  42.92 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3556  NUDIX hydrolase  45.15 
 
 		 249 aa  162  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0681296  normal  0.23927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  44.81 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  40.66 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  37.93 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  43.4 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  44.6 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  45.19 
 
 		 219 aa  158  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  39.51 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  38.35 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 255 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  41.4 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  42.74 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  41.86 
 
 		 662 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  45.41 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  42.99 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0351  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248655  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  41.46 
 
 		 245 aa  151  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  44.39 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  37.79 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  44.51 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 		 234 aa  148  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  42.33 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  42.25 
 
 		 202 aa  146  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  42.16 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03740  ADP-ribose pyrophosphatase  41.59 
 
 		 228 aa  145  8.000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0297346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  45.08 
 
 		 229 aa  144  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  39.9 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  41.21 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  42.13 
 
 		 246 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  46.36 
 
 		 244 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 233 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0240  ADP-ribose pyrophosphatase  41.23 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0563851  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  42.2 
 
 		 222 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  42.13 
 
 		 242 aa  142  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3393  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 		 248 aa  141  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.4746  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  36.04 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  36.98 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  36.65 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3729  NUDIX hydrolase  36.95 
 
 		 242 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7553  hypothetical protein  41.58 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.805753  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0395  NUDIX hydrolase  41.09 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5424  NUDIX hydrolase  34.18 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3167  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00016749  hitchhiker  0.000047705 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15670  hypothetical protein  37.89 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.238037  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2189  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 		 271 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4671  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 257 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.695959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2797  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 234 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.507012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11609  hypothetical protein  35.94 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.706015  normal  0.421109 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 250 aa  122  5e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  46.83 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2250  NUDIX hydrolase  34.6 
 
 		 244 aa  121  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3620  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0652578  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2009  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3069  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.41651  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3129  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.815886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5731  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3086  NUDIX hydrolase  38.97 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 		 186 aa  120  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>