More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2285 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 178 aa  364  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  39.38 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  36.71 
 
 		 171 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  38.18 
 
 		 164 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 164 aa  117  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  36.81 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 184 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  38.62 
 
 		 153 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  35.44 
 
 		 265 aa  85.5  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 154 aa  84.7  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 236 aa  81.3  0.000000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1423  NUDIX hydrolase  39.31 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  44.25 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  40.59 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  39.85 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  31.32 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  43.07 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2015  mutT/nudix family protein  35.56 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0857519  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  44.79 
 
 		 137 aa  73.9  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2651  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000859831 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  40.28 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 150 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  44.21 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3170  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  41.58 
 
 		 195 aa  72  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1340  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.902443 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 190 aa  72  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0613  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 171 aa  72  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 229 aa  70.9  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 183 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  45.78 
 
 		 182 aa  70.9  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  27.78 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2673  ADP-ribose pyrophosphatase  35.83 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0988  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000252657  hitchhiker  0.00430366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  43.18 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2139  NUDIX hydrolase  31.17 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  38.37 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  40.59 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1335  NUDIX hydrolase  39.05 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  31.11 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  44.95 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2947  NUDIX hydrolase  32.86 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  42.05 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1532  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  39.6 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  29.71 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  30.06 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  40.82 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  39.42 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  43.06 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  41 
 
 		 132 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 181 aa  67  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7147  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0778185 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2643  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  38.61 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4486  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.62 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.62 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.62 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  37.62 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  37.62 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.62 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 181 aa  65.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  37.62 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  37.62 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  34.82 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  41.11 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2130  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  43.48 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>