More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_3170 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_3170  NUDIX hydrolase  100 
 
 
178 aa  355  1.9999999999999998e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1423  NUDIX hydrolase  70.79 
 
 
198 aa  240  7.999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 
178 aa  94.7  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  46.39 
 
 
164 aa  88.2  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  43.3 
 
 
164 aa  86.7  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  43.01 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 
171 aa  85.9  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  44.33 
 
 
177 aa  82  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  43.62 
 
 
171 aa  81.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  40.62 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  36.69 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4486  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0992718  normal  0.0214705 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  30.26 
 
 
163 aa  72.4  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  41.46 
 
 
320 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 
187 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0997  NUDIX hydrolase  42.97 
 
 
153 aa  70.9  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.665088  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  42.02 
 
 
153 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  33.15 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 
187 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  30.6 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  43.59 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  34.84 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
187 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  37.3 
 
 
146 aa  68.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
185 aa  68.2  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  32.45 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 
187 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  30.99 
 
 
181 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  31.58 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 
181 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  32.34 
 
 
198 aa  66.2  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7147  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0778185 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  41.58 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  31.74 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  29.7 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  34.38 
 
 
236 aa  64.3  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  33.82 
 
 
195 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 
146 aa  63.5  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2130  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 
175 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  37.39 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  44.66 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
229 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.22 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  32.22 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2673  ADP-ribose pyrophosphatase  39.74 
 
 
166 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.22 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  32.22 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.22 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  30.18 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.22 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0105  NUDIX hydrolase  38.71 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  39 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
194 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  32.22 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  32.22 
 
 
181 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01202  NUDIX domain, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G13840)  47.22 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.264351  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  37.82 
 
 
229 aa  62.4  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 
194 aa  62.4  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  34.56 
 
 
195 aa  62.8  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  40.2 
 
 
144 aa  61.6  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
198 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  36.28 
 
 
157 aa  61.6  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
142 aa  61.6  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  38.95 
 
 
137 aa  61.6  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  30 
 
 
182 aa  61.6  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  35.88 
 
 
161 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
142 aa  61.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
198 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
152 aa  61.2  0.000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  27.59 
 
 
177 aa  61.2  0.000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2287  mutT/nudix family protein  41.18 
 
 
156 aa  61.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
181 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1194  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 
126 aa  60.8  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317663  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  33.58 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0783  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 
139 aa  60.5  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0156175  normal  0.134596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  60 
 
 
180 aa  60.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  36.19 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  38.94 
 
 
136 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0750  NUDIX hydrolase  40 
 
 
212 aa  60.5  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  39.62 
 
 
181 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  38.76 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  30.87 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  32.67 
 
 
265 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  42.45 
 
 
237 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  34.11 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1565  NUDIX hydrolase  39.17 
 
 
150 aa  59.3  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000493599  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  41.35 
 
 
269 aa  59.3  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2844  cytidyltransferase-related domain-containing protein  35.09 
 
 
342 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>