More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0747 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  370  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  68.39 
 
 		 179 aa  273  9e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  63.79 
 
 		 182 aa  251  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  63.79 
 
 		 181 aa  238  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  65.52 
 
 		 181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  63.22 
 
 		 181 aa  237  6.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  62.01 
 
 		 194 aa  236  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  62.64 
 
 		 181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  62.64 
 
 		 181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  62.64 
 
 		 181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  62.64 
 
 		 181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  62.64 
 
 		 181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  62.64 
 
 		 181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  62.64 
 
 		 181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  62.64 
 
 		 181 aa  231  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  60.34 
 
 		 194 aa  228  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  62.07 
 
 		 181 aa  229  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  60.34 
 
 		 198 aa  228  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  62.07 
 
 		 181 aa  228  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  62.07 
 
 		 181 aa  228  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  62.07 
 
 		 181 aa  228  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  60.34 
 
 		 198 aa  227  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  60.34 
 
 		 181 aa  227  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  57.65 
 
 		 183 aa  223  1e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  61.68 
 
 		 184 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  57.54 
 
 		 195 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  58.29 
 
 		 182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  57.54 
 
 		 195 aa  218  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  62.28 
 
 		 184 aa  218  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  58.1 
 
 		 195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  59.88 
 
 		 183 aa  217  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 182 aa  217  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  62.96 
 
 		 183 aa  216  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  60.67 
 
 		 196 aa  215  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 182 aa  214  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  62.35 
 
 		 183 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 182 aa  214  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  62.96 
 
 		 183 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  57.71 
 
 		 181 aa  213  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  61.73 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  58.99 
 
 		 201 aa  213  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  57.47 
 
 		 185 aa  210  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  56.73 
 
 		 181 aa  209  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  56 
 
 		 181 aa  208  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  58.72 
 
 		 187 aa  208  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  59.17 
 
 		 183 aa  208  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  58.52 
 
 		 198 aa  204  6e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  55.95 
 
 		 186 aa  204  7e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15850  hypothetical protein  63.47 
 
 		 184 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0332954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  55.29 
 
 		 183 aa  201  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  55.29 
 
 		 183 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  58 
 
 		 157 aa  194  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1077  NUDIX hydrolase  53.61 
 
 		 173 aa  190  9e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.167553 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  50.29 
 
 		 187 aa  186  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  54.27 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  48.55 
 
 		 187 aa  184  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  47.4 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  50.31 
 
 		 187 aa  179  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  50.31 
 
 		 187 aa  180  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  48.24 
 
 		 181 aa  179  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  46.82 
 
 		 187 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  46.78 
 
 		 187 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 		 187 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  46.2 
 
 		 187 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  55.48 
 
 		 183 aa  167  7e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  52.38 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 190 aa  97.8  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0013  NUDIX hydrolase  41.51 
 
 		 166 aa  94.4  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.466543  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  31.65 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  38.84 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  44.68 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 		 163 aa  72  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.84 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  37.84 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  33.09 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.84 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.84 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.84 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.84 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.84 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  38.02 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  37.19 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  31.39 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  36.49 
 
 		 176 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2686  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  35.81 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 187 aa  67.4  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 187 aa  67  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  36.73 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  35.77 
 
 		 198 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  36.89 
 
 		 170 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>