More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2899 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 187 aa  388  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  99.47 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  80.54 
 
 		 189 aa  316  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  74.73 
 
 		 192 aa  287  7e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  65.79 
 
 		 200 aa  268  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  67.23 
 
 		 177 aa  264  5e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  70.59 
 
 		 204 aa  261  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  70.29 
 
 		 177 aa  260  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  65.29 
 
 		 180 aa  238  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  64.42 
 
 		 178 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  63.86 
 
 		 183 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  63.64 
 
 		 209 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  63.86 
 
 		 183 aa  211  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  63.64 
 
 		 209 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  63.86 
 
 		 183 aa  211  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  63.86 
 
 		 183 aa  211  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  63.64 
 
 		 209 aa  210  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  61.31 
 
 		 178 aa  209  1e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  64.42 
 
 		 178 aa  210  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  62.58 
 
 		 178 aa  208  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  61.96 
 
 		 178 aa  205  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  61.96 
 
 		 178 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  61.96 
 
 		 178 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  54.89 
 
 		 194 aa  204  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  60.84 
 
 		 184 aa  204  9e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  59.04 
 
 		 193 aa  200  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  60.12 
 
 		 176 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  58.43 
 
 		 193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  60.12 
 
 		 176 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  57.83 
 
 		 193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  50.54 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  39.44 
 
 		 187 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 		 187 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  38.73 
 
 		 187 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  38.62 
 
 		 170 aa  89.7  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 		 184 aa  87.8  9e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  34.27 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  33.57 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 164 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  37.06 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  37.67 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 		 187 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 187 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  34.33 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  29.73 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  34.53 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  33.58 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  29.53 
 
 		 301 aa  71.2  0.000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  32.23 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  39.8 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  32.87 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  29.75 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  37.11 
 
 		 325 aa  68.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  33.79 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  33.88 
 
 		 184 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  30.5 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 177 aa  67  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  44.16 
 
 		 341 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 		 288 aa  67  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4236  NAD(+) diphosphatase  33.88 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0400368  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  27.71 
 
 		 291 aa  67  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  26.19 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  38.3 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  34.03 
 
 		 183 aa  65.9  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  29.86 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  39 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  31.47 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  28.67 
 
 		 293 aa  65.1  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  35.34 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30208  predicted protein  31.78 
 
 		 401 aa  63.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  25.95 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  28.77 
 
 		 261 aa  63.2  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  34.65 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1603  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0283951  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0187  NUDIX hydrolase  29.73 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.805777 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  29.22 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  31.3 
 
 		 327 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06890  Zn-finger containing NTP pyrophosphohydrolase  27.86 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.791391  normal  0.0533981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  34.17 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  33.62 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  31.78 
 
 		 313 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2018  NTP pyrophosphohydrolase  27.4 
 
 		 271 aa  62.4  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000204952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  30.43 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  26.8 
 
 		 319 aa  62  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  30.58 
 
 		 289 aa  62  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1467  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 		 135 aa  62  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  26.83 
 
 		 314 aa  61.6  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>