More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1903 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  100 
 
 
178 aa  364  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  91.57 
 
 
178 aa  342  2e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  91.57 
 
 
178 aa  340  9e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  91.57 
 
 
178 aa  339  1e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  90.45 
 
 
178 aa  338  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  90.45 
 
 
178 aa  338  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  89.89 
 
 
178 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  82.49 
 
 
184 aa  306  8e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  83.05 
 
 
183 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  83.05 
 
 
183 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  83.05 
 
 
183 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  83.05 
 
 
183 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  83.05 
 
 
209 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  83.05 
 
 
209 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  83.05 
 
 
209 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  80.57 
 
 
176 aa  297  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  78.86 
 
 
176 aa  294  4e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  65.29 
 
 
193 aa  234  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  65.88 
 
 
193 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  65.29 
 
 
193 aa  232  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  61.99 
 
 
194 aa  223  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  60.61 
 
 
200 aa  210  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  57.95 
 
 
204 aa  210  7.999999999999999e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  61.31 
 
 
187 aa  209  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  56.65 
 
 
198 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  60.71 
 
 
187 aa  206  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  56.73 
 
 
177 aa  202  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  55.56 
 
 
177 aa  201  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  55.81 
 
 
180 aa  197  6e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  60.24 
 
 
192 aa  196  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  58.93 
 
 
189 aa  195  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  37.01 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  40.14 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
187 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  34.01 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  35.51 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  40.62 
 
 
170 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 
187 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
187 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  38.57 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  42.52 
 
 
177 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  39.01 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 
164 aa  74.3  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  32.35 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  37.69 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  32.18 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  34.83 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 
261 aa  71.2  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 
314 aa  70.9  0.000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  32.16 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  30.67 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  41.04 
 
 
164 aa  69.3  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
286 aa  69.3  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  34.71 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
317 aa  67.4  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  33.56 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 
186 aa  67  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  29.3 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0527  hypothetical protein  34.13 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0926831  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  31.76 
 
 
303 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  30.43 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3971  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  32.48 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  33.9 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  33.11 
 
 
187 aa  65.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  31.97 
 
 
269 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  37.74 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  29.91 
 
 
289 aa  65.5  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  38 
 
 
323 aa  65.1  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  33.77 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  30.41 
 
 
183 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  27.68 
 
 
317 aa  65.1  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 
293 aa  64.7  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  31.15 
 
 
339 aa  64.7  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2968  NAD(+) diphosphatase  33.58 
 
 
303 aa  64.3  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 
212 aa  64.3  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.16 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.16 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.16 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  32.16 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  32.16 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  32.16 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
298 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  32.16 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  33.06 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  32.16 
 
 
181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  31.93 
 
 
341 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 
181 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  34 
 
 
196 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1940  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 
262 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1514  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
307 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.315266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>