295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0860 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 194 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  79.79 
 
 		 198 aa  332  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  68.06 
 
 		 193 aa  258  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  71.11 
 
 		 193 aa  256  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  70.56 
 
 		 193 aa  254  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  64.91 
 
 		 178 aa  226  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  64.33 
 
 		 178 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  63.74 
 
 		 176 aa  224  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  63.74 
 
 		 178 aa  224  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  61.99 
 
 		 178 aa  223  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  63.74 
 
 		 178 aa  223  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  63.74 
 
 		 178 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  63.74 
 
 		 178 aa  223  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  62.35 
 
 		 183 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  62.35 
 
 		 183 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  62.35 
 
 		 183 aa  222  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  62.35 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  62.35 
 
 		 184 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  62.35 
 
 		 183 aa  222  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  62.35 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  62.35 
 
 		 209 aa  223  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  62.57 
 
 		 176 aa  220  8e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  54.89 
 
 		 187 aa  204  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  55.43 
 
 		 177 aa  201  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  54.35 
 
 		 187 aa  201  8e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  57.4 
 
 		 177 aa  199  3e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  52.2 
 
 		 189 aa  198  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  52.66 
 
 		 192 aa  198  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  56.63 
 
 		 204 aa  197  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  52 
 
 		 200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  55.21 
 
 		 180 aa  182  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  41.91 
 
 		 184 aa  93.2  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  43.45 
 
 		 170 aa  92.8  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  42.54 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  40.88 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  42.31 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  37.96 
 
 		 171 aa  77.8  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  33.57 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  30.87 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0289  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  32.17 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  30.07 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0794  NUDIX hydrolase  28.69 
 
 		 314 aa  67  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  31.34 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4689  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 297 aa  65.9  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276951  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  30.89 
 
 		 283 aa  64.3  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  30.66 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13222  NADH pyrophosphatase  29.52 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.861891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  37.38 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2937  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000463524  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  28.87 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30208  predicted protein  30.51 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7803  NUDIX hydrolase  33.91 
 
 		 341 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  32.77 
 
 		 319 aa  62  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0708  NUDIX hydrolase  26.59 
 
 		 317 aa  61.6  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  31.97 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 323 aa  61.6  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  30.08 
 
 		 278 aa  61.6  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  28.17 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  33.05 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  28.12 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2829  phosphohydrolase  29.51 
 
 		 289 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0306563  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  29.46 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  31.21 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3745  NAD(+) diphosphatase  29.77 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00545287  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0522  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0294847  normal  0.653584 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0962  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0238968  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2363  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 317 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  29.91 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  32.35 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0257  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 		 325 aa  58.9  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  30.88 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2471  NAD(+) diphosphatase  31.62 
 
 		 332 aa  58.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041895  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  29.41 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1412  NUDIX hydrolase  25.87 
 
 		 339 aa  58.5  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  28.93 
 
 		 301 aa  58.2  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  36.63 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  29.1 
 
 		 183 aa  57.8  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  30.77 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2072  NUDIX hydrolase  28.8 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.453494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1074  NUDIX hydrolase  28.1 
 
 		 261 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0108  mutT/nudix family protein  31.4 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.579129  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0170  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00222  NADH pyrophosphatase  29.2 
 
 		 269 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0273  NUDIX hydrolase  30.25 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0987192 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>