More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1297 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1297  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 192 aa  400  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1027  NUDIX hydrolase  75.96 
 
 		 189 aa  296  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.624185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2385  NUDIX hydrolase  75.27 
 
 		 187 aa  290  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.189203  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2899  NUDIX hydrolase  74.73 
 
 		 187 aa  287  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3725  NUDIX hydrolase  74.71 
 
 		 177 aa  274  5e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.962326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3171  NUDIX hydrolase  71.18 
 
 		 177 aa  262  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1988  NUDIX hydrolase  72.62 
 
 		 204 aa  261  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104841 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  62.43 
 
 		 200 aa  234  7e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1133  putative phosphatase  65.29 
 
 		 180 aa  231  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118269 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0714  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  59.64 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.429601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0903  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  59.64 
 
 		 183 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.332961  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1821  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  59.64 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0447  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  59.64 
 
 		 209 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1432  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  59.64 
 
 		 183 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1666  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  59.64 
 
 		 183 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1643  NUDIX family hydrolase  59.64 
 
 		 183 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1292  NUDIX hydrolase  60.12 
 
 		 178 aa  199  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.387319  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0860  NUDIX hydrolase  52.66 
 
 		 194 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1331  NUDIX hydrolase  60.12 
 
 		 178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.051474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  60.24 
 
 		 178 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0755  NUDIX hydrolase  59.01 
 
 		 193 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0327905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0825  NUDIX hydrolase  59.01 
 
 		 193 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.184951 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2657  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  57.83 
 
 		 184 aa  195  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0930  NUDIX hydrolase  61.49 
 
 		 178 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0433868  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1412  NUDIX hydrolase  61.49 
 
 		 178 aa  195  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533482  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1390  NUDIX hydrolase  59.64 
 
 		 178 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.251426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  58.79 
 
 		 176 aa  194  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  60.24 
 
 		 178 aa  194  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0809  hypothetical protein  58.39 
 
 		 193 aa  193  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  58.18 
 
 		 176 aa  190  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0810  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  36.99 
 
 		 184 aa  86.3  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  37.93 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  32.88 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  35.17 
 
 		 171 aa  77.8  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  30.97 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3307  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000568328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  35.92 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  35.92 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.92 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  35.92 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.92 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0170  NAD(+) diphosphatase  29.2 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.92 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  35.92 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  35.92 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  32.19 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0254  NUDIX hydrolase  33.06 
 
 		 319 aa  75.1  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  34.78 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  36.67 
 
 		 170 aa  74.7  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  30.82 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3794  NAD(+) diphosphatase  29.66 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0019252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  34.51 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  33.81 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0796  NUDIX hydrolase  29.01 
 
 		 286 aa  72  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.192656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 181 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  35 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  33.1 
 
 		 198 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  32.39 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  30.94 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0153  NAD(+) diphosphatase  37.5 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.354363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2462  NUDIX hydrolase  29.87 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.77849  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2170  NUDIX hydrolase  30.23 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1603  NUDIX/MutT family protein  35.88 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.79603  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3700  NUDIX hydrolase  29.5 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.663184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0714  NUDIX hydrolase  32.65 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  29.44 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  30.28 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  31.39 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0886  NUDIX hydrolase  29.17 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.972905  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4576  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 323 aa  68.9  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  30.5 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  32.12 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2470  NUDIX hydrolase  28.03 
 
 		 298 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0651  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 318 aa  67.8  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.520333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  30.15 
 
 		 185 aa  67.8  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  37.07 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1747  NAD(+) diphosphatase  29.57 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  37.37 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2264  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 289 aa  67  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>